[300] | 1 | // ----------------------------------------------------------------------- |
---|
| 2 | // columns.cc: Define a set of columns for Duchamp output. |
---|
| 3 | // ----------------------------------------------------------------------- |
---|
| 4 | // Copyright (C) 2006, Matthew Whiting, ATNF |
---|
| 5 | // |
---|
| 6 | // This program is free software; you can redistribute it and/or modify it |
---|
| 7 | // under the terms of the GNU General Public License as published by the |
---|
| 8 | // Free Software Foundation; either version 2 of the License, or (at your |
---|
| 9 | // option) any later version. |
---|
| 10 | // |
---|
| 11 | // Duchamp is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT |
---|
| 12 | // ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or |
---|
| 13 | // FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU General Public License |
---|
| 14 | // for more details. |
---|
| 15 | // |
---|
| 16 | // You should have received a copy of the GNU General Public License |
---|
| 17 | // along with Duchamp; if not, write to the Free Software Foundation, |
---|
| 18 | // Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307, USA |
---|
| 19 | // |
---|
| 20 | // Correspondence concerning Duchamp may be directed to: |
---|
| 21 | // Internet email: Matthew.Whiting [at] atnf.csiro.au |
---|
| 22 | // Postal address: Dr. Matthew Whiting |
---|
| 23 | // Australia Telescope National Facility, CSIRO |
---|
| 24 | // PO Box 76 |
---|
| 25 | // Epping NSW 1710 |
---|
| 26 | // AUSTRALIA |
---|
| 27 | // ----------------------------------------------------------------------- |
---|
[144] | 28 | #include <iostream> |
---|
| 29 | #include <sstream> |
---|
| 30 | |
---|
[155] | 31 | #include <math.h> |
---|
[393] | 32 | #include <duchamp/duchamp.hh> |
---|
| 33 | #include <duchamp/fitsHeader.hh> |
---|
[93] | 34 | #include <vector> |
---|
| 35 | #include <string> |
---|
[393] | 36 | #include <duchamp/Detection/detection.hh> |
---|
| 37 | #include <duchamp/Detection/columns.hh> |
---|
[93] | 38 | |
---|
[378] | 39 | namespace duchamp |
---|
[232] | 40 | { |
---|
[221] | 41 | |
---|
[378] | 42 | namespace Column |
---|
[272] | 43 | { |
---|
[221] | 44 | |
---|
[378] | 45 | Col::Col() |
---|
| 46 | { |
---|
| 47 | /** Set the default values for the parameters. */ |
---|
| 48 | this->width=1; |
---|
| 49 | this->precision=0; |
---|
| 50 | this->name=" "; |
---|
| 51 | this->units=" "; |
---|
| 52 | }; |
---|
[232] | 53 | |
---|
[378] | 54 | Col::~Col(){} |
---|
[365] | 55 | |
---|
[378] | 56 | Col::Col(const Col& c) |
---|
| 57 | { |
---|
| 58 | operator=(c); |
---|
| 59 | } |
---|
[365] | 60 | |
---|
[378] | 61 | Col& Col::operator=(const Col& c) |
---|
| 62 | { |
---|
| 63 | if(this==&c) return *this; |
---|
| 64 | this->width = c.width; |
---|
| 65 | this->precision = c.precision; |
---|
| 66 | this->name = c.name; |
---|
| 67 | this->units = c.units; |
---|
| 68 | return *this; |
---|
[232] | 69 | } |
---|
[378] | 70 | |
---|
| 71 | Col::Col(int num) |
---|
| 72 | { |
---|
| 73 | /** |
---|
| 74 | * A specialised constructor that defines one of the default |
---|
| 75 | * columns, as defined in the Column namespace |
---|
| 76 | * \param num The number of the column to be constructed. |
---|
| 77 | * Corresponds to the order of the columns in the const |
---|
| 78 | * arrays in the Column namespace. |
---|
| 79 | */ |
---|
| 80 | if((num>=0)&&(num<numColumns)){ |
---|
| 81 | this->width = defaultWidth[num]; |
---|
| 82 | this->precision = defaultPrec[num]; |
---|
| 83 | this->name = defaultName[num]; |
---|
| 84 | this->units = defaultUnits[num]; |
---|
| 85 | } |
---|
| 86 | else{ |
---|
| 87 | std::stringstream errmsg; |
---|
| 88 | errmsg << "Incorrect value for Col(num) --> num="<<num |
---|
| 89 | << ", should be between 0 and " << numColumns-1 << ".\n"; |
---|
| 90 | duchampError("Column constructor", errmsg.str()); |
---|
| 91 | this->width = 1; |
---|
| 92 | this->precision = 0; |
---|
| 93 | this->name = " "; |
---|
| 94 | this->units = " "; |
---|
| 95 | } |
---|
[232] | 96 | } |
---|
[378] | 97 | //------------------------------------------------------------ |
---|
| 98 | void Col::printTitle(std::ostream &stream) |
---|
| 99 | { |
---|
| 100 | stream << std::setw(this->width) |
---|
| 101 | << std::setfill(' ') |
---|
| 102 | << this->name; |
---|
| 103 | } |
---|
[93] | 104 | |
---|
[378] | 105 | void Col::printUnits(std::ostream &stream) |
---|
| 106 | { |
---|
| 107 | stream << std::setw(this->width) |
---|
| 108 | << std::setfill(' ') |
---|
| 109 | << this->units; |
---|
| 110 | } |
---|
[272] | 111 | |
---|
[378] | 112 | void Col::printDash (std::ostream &stream) |
---|
| 113 | { |
---|
| 114 | stream << std::setw(this->width) |
---|
| 115 | << std::setfill('-') |
---|
| 116 | << "" |
---|
| 117 | << std::setfill(' '); |
---|
| 118 | } |
---|
[232] | 119 | |
---|
[378] | 120 | void Col::printBlank(std::ostream &stream) |
---|
| 121 | { |
---|
| 122 | stream << std::setw(this->width) |
---|
| 123 | << std::setfill(' ') |
---|
| 124 | << ""; |
---|
| 125 | } |
---|
[272] | 126 | |
---|
[378] | 127 | template <class T> void Col::printEntry(std::ostream &stream, T value) |
---|
| 128 | { |
---|
| 129 | /** |
---|
| 130 | * \param stream Where the printing is done. |
---|
| 131 | * \param value The value to be printed. |
---|
| 132 | */ |
---|
| 133 | stream << std::setprecision(this->precision) |
---|
| 134 | << std::setw(this->width) |
---|
| 135 | << std::setfill(' ') |
---|
| 136 | << value; |
---|
| 137 | } |
---|
| 138 | template void Col::printEntry<int>(std::ostream &stream, int value); |
---|
| 139 | template void Col::printEntry<long>(std::ostream &stream, long value); |
---|
| 140 | template void Col::printEntry<unsigned>(std::ostream &stream, unsigned value); |
---|
| 141 | template void Col::printEntry<float>(std::ostream &stream, float value); |
---|
| 142 | template void Col::printEntry<double>(std::ostream &stream, double value); |
---|
| 143 | template void Col::printEntry<std::string>(std::ostream &stream, std::string value); |
---|
[272] | 144 | |
---|
[378] | 145 | |
---|
[221] | 146 | |
---|
[378] | 147 | std::vector<Col> getFullColSet(std::vector<Detection> &objectList, |
---|
| 148 | FitsHeader &head) |
---|
| 149 | { |
---|
| 150 | /** |
---|
| 151 | * A function that returns a std::vector of Col objects containing |
---|
| 152 | * information on the columns necessary for output to the results |
---|
| 153 | * file: |
---|
| 154 | * Obj#,NAME,X,Y,Z,RA,DEC,VEL,w_RA,w_DEC,w_VEL,F_tot,F_int,F_peak, |
---|
| 155 | * X1,X2,Y1,Y2,Z1,Z2,Npix,Flag |
---|
| 156 | * |
---|
| 157 | * Each object in the provided objectList is checked to see if it |
---|
| 158 | * requires any column to be widened, or for that column to have |
---|
| 159 | * its precision increased. |
---|
| 160 | * |
---|
| 161 | * Both Ftot and Fint are provided -- it is up to the calling |
---|
| 162 | * function to determine which to use. |
---|
| 163 | * |
---|
| 164 | * \param objectList A std::vector list of Detection objects that the |
---|
| 165 | * columns need to fit. |
---|
| 166 | * \param head The FitsHeader object defining the World Coordinate |
---|
| 167 | * System. |
---|
| 168 | * \return A std::vector list of Col definitions. |
---|
| 169 | */ |
---|
[93] | 170 | |
---|
[378] | 171 | std::vector<Col> newset; |
---|
[93] | 172 | |
---|
[378] | 173 | // set up the default columns |
---|
[93] | 174 | |
---|
[378] | 175 | newset.push_back( Col(NUM) ); |
---|
| 176 | newset.push_back( Col(NAME) ); |
---|
| 177 | newset.push_back( Col(X) ); |
---|
| 178 | newset.push_back( Col(Y) ); |
---|
| 179 | newset.push_back( Col(Z) ); |
---|
| 180 | newset.push_back( Col(RA) ); |
---|
| 181 | newset.push_back( Col(DEC) ); |
---|
| 182 | newset.push_back( Col(VEL) ); |
---|
| 183 | newset.push_back( Col(WRA) ); |
---|
| 184 | newset.push_back( Col(WDEC) ); |
---|
| 185 | newset.push_back( Col(WVEL) ); |
---|
| 186 | newset.push_back( Col(FINT) ); |
---|
| 187 | newset.push_back( Col(FTOT) ); |
---|
| 188 | newset.push_back( Col(FPEAK) ); |
---|
| 189 | newset.push_back( Col(SNRPEAK) ); |
---|
| 190 | newset.push_back( Col(X1) ); |
---|
| 191 | newset.push_back( Col(X2) ); |
---|
| 192 | newset.push_back( Col(Y1) ); |
---|
| 193 | newset.push_back( Col(Y2) ); |
---|
| 194 | newset.push_back( Col(Z1) ); |
---|
| 195 | newset.push_back( Col(Z2) ); |
---|
| 196 | newset.push_back( Col(NPIX) ); |
---|
| 197 | newset.push_back( Col(FLAG) ); |
---|
| 198 | newset.push_back( Col(XAV) ); |
---|
| 199 | newset.push_back( Col(YAV) ); |
---|
| 200 | newset.push_back( Col(ZAV) ); |
---|
| 201 | newset.push_back( Col(XCENT) ); |
---|
| 202 | newset.push_back( Col(YCENT) ); |
---|
| 203 | newset.push_back( Col(ZCENT) ); |
---|
| 204 | newset.push_back( Col(XPEAK) ); |
---|
| 205 | newset.push_back( Col(YPEAK) ); |
---|
| 206 | newset.push_back( Col(ZPEAK) ); |
---|
[93] | 207 | |
---|
[378] | 208 | // Now test each object against each new column |
---|
| 209 | for( int obj = 0; obj < objectList.size(); obj++){ |
---|
| 210 | std::string tempstr; |
---|
| 211 | int tempwidth; |
---|
| 212 | float val,minval; |
---|
[93] | 213 | |
---|
[378] | 214 | // Obj# |
---|
| 215 | tempwidth = int( log10(objectList[obj].getID()) + 1) + |
---|
| 216 | newset[NUM].getPrecision() + 1; |
---|
| 217 | for(int i=newset[NUM].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[NUM].widen(); |
---|
[93] | 218 | |
---|
[378] | 219 | // Name |
---|
| 220 | tempwidth = objectList[obj].getName().size() + 1; |
---|
| 221 | for(int i=newset[NAME].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[NAME].widen(); |
---|
[93] | 222 | |
---|
[378] | 223 | // X position |
---|
| 224 | val = objectList[obj].getXcentre() + objectList[obj].getXOffset(); |
---|
| 225 | if((val<1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 226 | minval = pow(10, -1. * (newset[X].getPrecision()+1)); |
---|
| 227 | if(val < minval) newset[X].upPrec(); |
---|
| 228 | } |
---|
| 229 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[X].getPrecision() + 2; |
---|
| 230 | for(int i=newset[X].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[X].widen(); |
---|
| 231 | // Y position |
---|
| 232 | val = objectList[obj].getYcentre() + objectList[obj].getYOffset(); |
---|
| 233 | if((val<1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 234 | minval = pow(10, -1. * (newset[Y].getPrecision()+1)); |
---|
| 235 | if(val < minval) newset[Y].upPrec(); |
---|
| 236 | } |
---|
| 237 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[Y].getPrecision() + 2; |
---|
| 238 | for(int i=newset[Y].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[Y].widen(); |
---|
| 239 | // Z position |
---|
| 240 | val = objectList[obj].getZcentre() + objectList[obj].getZOffset(); |
---|
| 241 | if((val<1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 242 | minval = pow(10, -1. * (newset[Z].getPrecision()+1)); |
---|
| 243 | if((val>0.)&&(val < minval)) newset[Z].upPrec(); |
---|
| 244 | } |
---|
| 245 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[Z].getPrecision() + 2; |
---|
| 246 | for(int i=newset[Z].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[Z].widen(); |
---|
[93] | 247 | |
---|
[378] | 248 | if(head.isWCS()){ |
---|
| 249 | // RA -- assign correct title. Check width but should be ok by definition |
---|
| 250 | tempstr = head.WCS().lngtyp; |
---|
| 251 | newset[RA].setName(tempstr); |
---|
| 252 | tempwidth = objectList[obj].getRAs().size() + 1; |
---|
| 253 | for(int i=newset[RA].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[RA].widen(); |
---|
[144] | 254 | |
---|
[378] | 255 | // Dec -- assign correct title. Check width, should be ok by definition |
---|
| 256 | tempstr = head.WCS().lattyp; |
---|
| 257 | newset[DEC].setName(tempstr); |
---|
| 258 | tempwidth = objectList[obj].getDecs().size() + 1; |
---|
| 259 | for(int i=newset[DEC].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[DEC].widen(); |
---|
[93] | 260 | |
---|
[378] | 261 | // Vel -- check width, title and units. |
---|
| 262 | //if(head.isSpecOK()){ |
---|
| 263 | if(head.canUseThirdAxis()){ |
---|
| 264 | if(head.WCS().restfrq == 0) // using frequency, not velocity |
---|
| 265 | newset[VEL].setName("FREQ"); |
---|
| 266 | if(head.getSpectralUnits().size()>0) |
---|
| 267 | newset[VEL].setUnits("[" + head.getSpectralUnits() + "]"); |
---|
| 268 | tempwidth = newset[VEL].getUnits().size() + 1; |
---|
| 269 | for(int i=newset[VEL].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[VEL].widen(); |
---|
[271] | 270 | |
---|
[378] | 271 | val = objectList[obj].getVel(); |
---|
| 272 | if((fabs(val) < 1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 273 | minval = pow(10, -1. * (newset[VEL].getPrecision()+1)); |
---|
| 274 | if(val < minval) newset[VEL].upPrec(); |
---|
| 275 | } |
---|
| 276 | tempwidth = int(log10(fabs(val)) + 1) + newset[VEL].getPrecision() + 2; |
---|
| 277 | if(val<0) tempwidth++; |
---|
| 278 | for(int i=newset[VEL].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[VEL].widen(); |
---|
| 279 | } |
---|
[93] | 280 | |
---|
[378] | 281 | // w_RA -- check width & title. leave units for the moment. |
---|
| 282 | tempwidth = newset[RA].getUnits().size() + 1; |
---|
| 283 | for(int i=newset[RA].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[RA].widen(); |
---|
| 284 | val = objectList[obj].getRAWidth(); |
---|
| 285 | if((fabs(val) < 1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 286 | minval = pow(10, -1. * (newset[WRA].getPrecision()+1)); |
---|
| 287 | if(val < minval) newset[WRA].upPrec(); |
---|
| 288 | } |
---|
| 289 | tempwidth = int( log10(fabs(val)) + 1) + newset[WRA].getPrecision() + 2; |
---|
| 290 | if(val<0) tempwidth++; |
---|
| 291 | for(int i=newset[WRA].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[WRA].widen(); |
---|
[136] | 292 | |
---|
[378] | 293 | // w_DEC -- check width & title. leave units for the moment. |
---|
| 294 | tempwidth = newset[DEC].getUnits().size() + 1; |
---|
| 295 | for(int i=newset[DEC].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[DEC].widen(); |
---|
| 296 | val = objectList[obj].getDecWidth(); |
---|
| 297 | if((fabs(val) < 1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 298 | minval = pow(10, -1. * (newset[WDEC].getPrecision()+1)); |
---|
| 299 | if(val < minval) newset[WDEC].upPrec(); |
---|
| 300 | } |
---|
| 301 | tempwidth = int( log10(fabs(val)) + 1) + newset[WDEC].getPrecision() + 2; |
---|
| 302 | if(val<0) tempwidth++; |
---|
| 303 | for(int i=newset[WDEC].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[WDEC].widen(); |
---|
[136] | 304 | |
---|
[378] | 305 | // w_Vel -- check width, title and units. |
---|
| 306 | //if(head.isSpecOK()){ |
---|
| 307 | if(head.canUseThirdAxis()){ |
---|
| 308 | if(head.WCS().restfrq == 0) // using frequency, not velocity |
---|
| 309 | newset[WVEL].setName("w_FREQ"); |
---|
| 310 | if(head.getSpectralUnits().size()>0) |
---|
| 311 | newset[WVEL].setUnits("[" + head.getSpectralUnits() + "]"); |
---|
| 312 | tempwidth = newset[WVEL].getUnits().size() + 1; |
---|
| 313 | for(int i=newset[WVEL].getWidth();i<tempwidth;i++)newset[WVEL].widen(); |
---|
| 314 | val = objectList[obj].getVel(); |
---|
| 315 | if((fabs(val) < 1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 316 | minval = pow(10, -1. * (newset[WVEL].getPrecision()+1)); |
---|
| 317 | if(val < minval) newset[WVEL].upPrec(); |
---|
| 318 | } |
---|
| 319 | tempwidth = int( log10(fabs(val)) + 1) + newset[WVEL].getPrecision() + 2; |
---|
| 320 | if(val<0) tempwidth++; |
---|
| 321 | for(int i=newset[WVEL].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[WVEL].widen(); |
---|
| 322 | } |
---|
[136] | 323 | |
---|
[378] | 324 | // F_int -- check width & units |
---|
| 325 | if(head.getIntFluxUnits().size()>0) |
---|
| 326 | newset[FINT].setUnits("[" + head.getIntFluxUnits() + "]"); |
---|
| 327 | tempwidth = newset[FINT].getUnits().size() + 1; |
---|
| 328 | for(int i=newset[FINT].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[FINT].widen(); |
---|
| 329 | val = objectList[obj].getIntegFlux(); |
---|
| 330 | if((fabs(val) < 1.)// &&(val>0.) |
---|
| 331 | ){ |
---|
| 332 | int minprec = int(fabs(log10(fabs(val))))+2; |
---|
| 333 | for(int i=newset[FINT].getPrecision();i<minprec;i++) newset[FINT].upPrec(); |
---|
| 334 | } |
---|
| 335 | tempwidth = int( log10(fabs(val)) + 1) + newset[FINT].getPrecision() + 2; |
---|
| 336 | if(val<0) tempwidth++; |
---|
| 337 | for(int i=newset[FINT].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[FINT].widen(); |
---|
[365] | 338 | |
---|
[378] | 339 | } |
---|
[136] | 340 | |
---|
[378] | 341 | // F_tot |
---|
| 342 | newset[FTOT].setUnits("[" + head.getFluxUnits() + "]"); |
---|
| 343 | tempwidth = newset[FTOT].getUnits().size() + 1; |
---|
| 344 | for(int i=newset[FTOT].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[FTOT].widen(); |
---|
| 345 | val = objectList[obj].getTotalFlux(); |
---|
| 346 | // std::cerr << val << "\n"; |
---|
| 347 | if((fabs(val) < 1.)// &&(val>0.) |
---|
| 348 | ){ |
---|
| 349 | int minprec = int(fabs(log10(fabs(val))))+2; |
---|
| 350 | for(int i=newset[FTOT].getPrecision();i<minprec;i++) newset[FTOT].upPrec(); |
---|
| 351 | } |
---|
| 352 | tempwidth = int( log10(fabs(val)) + 1) + newset[FTOT].getPrecision() + 2; |
---|
| 353 | if(val<0) tempwidth++; |
---|
| 354 | for(int i=newset[FTOT].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[FTOT].widen(); |
---|
[136] | 355 | |
---|
[378] | 356 | // F_peak |
---|
| 357 | newset[FPEAK].setUnits("[" + head.getFluxUnits() + "]"); |
---|
| 358 | tempwidth = newset[FPEAK].getUnits().size() + 1; |
---|
| 359 | for(int i=newset[FPEAK].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[FPEAK].widen(); |
---|
| 360 | val = objectList[obj].getPeakFlux(); |
---|
| 361 | if((fabs(val) < 1.)// &&(val>0.) |
---|
| 362 | ){ |
---|
| 363 | int minprec = int(fabs(log10(fabs(val))))+2; |
---|
| 364 | for(int i=newset[FPEAK].getPrecision();i<minprec;i++) newset[FPEAK].upPrec(); |
---|
| 365 | } |
---|
| 366 | tempwidth = int( log10(fabs(val)) + 1) + newset[FPEAK].getPrecision() + 2; |
---|
| 367 | if(val<0) tempwidth++; |
---|
| 368 | for(int i=newset[FPEAK].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[FPEAK].widen(); |
---|
[136] | 369 | |
---|
[378] | 370 | // S/N_peak |
---|
| 371 | val = objectList[obj].getPeakSNR(); |
---|
| 372 | if((fabs(val) < 1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 373 | minval = pow(10, -1. * (newset[SNRPEAK].getPrecision()+1)); |
---|
| 374 | if(val < minval) newset[SNRPEAK].upPrec(); |
---|
| 375 | } |
---|
| 376 | tempwidth = int( log10(fabs(val)) + 1) + newset[SNRPEAK].getPrecision() +2; |
---|
| 377 | if(val<0) tempwidth++; |
---|
| 378 | for(int i=newset[SNRPEAK].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[SNRPEAK].widen(); |
---|
[191] | 379 | |
---|
[378] | 380 | // X1 position |
---|
| 381 | val = objectList[obj].getXmin() + objectList[obj].getXOffset(); |
---|
| 382 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[X1].getPrecision() + 1; |
---|
| 383 | for(int i=newset[X1].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[X1].widen(); |
---|
| 384 | // X2 position |
---|
| 385 | val = objectList[obj].getXmax() + objectList[obj].getXOffset(); |
---|
| 386 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[X2].getPrecision() + 1; |
---|
| 387 | for(int i=newset[X2].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[X2].widen(); |
---|
| 388 | // Y1 position |
---|
| 389 | val = objectList[obj].getYmin() + objectList[obj].getYOffset(); |
---|
| 390 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[Y1].getPrecision() + 1; |
---|
| 391 | for(int i=newset[Y1].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[Y1].widen(); |
---|
| 392 | // Y2 position |
---|
| 393 | val = objectList[obj].getYmax() + objectList[obj].getYOffset(); |
---|
| 394 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[Y2].getPrecision() + 1; |
---|
| 395 | for(int i=newset[Y2].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[Y2].widen(); |
---|
| 396 | // Z1 position |
---|
| 397 | val = objectList[obj].getZmin() + objectList[obj].getZOffset(); |
---|
| 398 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[Z1].getPrecision() + 1; |
---|
| 399 | for(int i=newset[Z1].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[Z1].widen(); |
---|
| 400 | // Z2 position |
---|
| 401 | val = objectList[obj].getZmax() + objectList[obj].getZOffset(); |
---|
| 402 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[Z2].getPrecision() + 1; |
---|
| 403 | for(int i=newset[Z2].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[Z2].widen(); |
---|
[136] | 404 | |
---|
[378] | 405 | // Npix |
---|
| 406 | tempwidth = int( log10(objectList[obj].getSize()) + 1) + |
---|
| 407 | newset[NPIX].getPrecision() + 1; |
---|
| 408 | for(int i=newset[NPIX].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[NPIX].widen(); |
---|
[144] | 409 | |
---|
[378] | 410 | // average X position |
---|
| 411 | val = objectList[obj].getXAverage() + objectList[obj].getXOffset(); |
---|
| 412 | if((val<1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 413 | minval = pow(10, -1. * (newset[XAV].getPrecision()+1)); |
---|
| 414 | if(val < minval) newset[XAV].upPrec(); |
---|
| 415 | } |
---|
| 416 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[XAV].getPrecision() + 2; |
---|
| 417 | for(int i=newset[XAV].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[XAV].widen(); |
---|
| 418 | // average Y position |
---|
| 419 | val = objectList[obj].getYAverage() + objectList[obj].getYOffset(); |
---|
| 420 | if((val<1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 421 | minval = pow(10, -1. * (newset[YAV].getPrecision()+1)); |
---|
| 422 | if(val < minval) newset[YAV].upPrec(); |
---|
| 423 | } |
---|
| 424 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[YAV].getPrecision() + 2; |
---|
| 425 | for(int i=newset[YAV].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[YAV].widen(); |
---|
| 426 | // average Z position |
---|
| 427 | val = objectList[obj].getZAverage() + objectList[obj].getZOffset(); |
---|
| 428 | if((val<1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 429 | minval = pow(10, -1. * (newset[ZAV].getPrecision()+1)); |
---|
| 430 | if((val>0.)&&(val < minval)) newset[ZAV].upPrec(); |
---|
| 431 | } |
---|
| 432 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[ZAV].getPrecision() + 2; |
---|
| 433 | for(int i=newset[ZAV].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[ZAV].widen(); |
---|
[265] | 434 | |
---|
[378] | 435 | // X position of centroid |
---|
| 436 | val = objectList[obj].getXCentroid() + objectList[obj].getXOffset(); |
---|
| 437 | if((val<1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 438 | minval = pow(10, -1. * (newset[XCENT].getPrecision()+1)); |
---|
| 439 | if(val < minval) newset[XCENT].upPrec(); |
---|
| 440 | } |
---|
| 441 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[XCENT].getPrecision() + 2; |
---|
| 442 | for(int i=newset[XCENT].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[XCENT].widen(); |
---|
| 443 | // Y position of centroid |
---|
| 444 | val = objectList[obj].getYCentroid() + objectList[obj].getYOffset(); |
---|
| 445 | if((val<1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 446 | minval = pow(10, -1. * (newset[YCENT].getPrecision()+1)); |
---|
| 447 | if(val < minval) newset[YCENT].upPrec(); |
---|
| 448 | } |
---|
| 449 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[YCENT].getPrecision() + 2; |
---|
| 450 | for(int i=newset[YCENT].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[YCENT].widen(); |
---|
| 451 | // Z position of centroid |
---|
| 452 | val = objectList[obj].getZCentroid() + objectList[obj].getZOffset(); |
---|
| 453 | if((val<1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 454 | minval = pow(10, -1. * (newset[ZCENT].getPrecision()+1)); |
---|
| 455 | if((val>0.)&&(val < minval)) newset[ZCENT].upPrec(); |
---|
| 456 | } |
---|
| 457 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[ZCENT].getPrecision() + 2; |
---|
| 458 | for(int i=newset[ZCENT].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[ZCENT].widen(); |
---|
[265] | 459 | |
---|
[378] | 460 | // X position of peak flux |
---|
| 461 | val = objectList[obj].getXPeak() + objectList[obj].getXOffset(); |
---|
| 462 | if((val<1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 463 | minval = pow(10, -1. * (newset[XPEAK].getPrecision()+1)); |
---|
| 464 | if(val < minval) newset[XPEAK].upPrec(); |
---|
| 465 | } |
---|
| 466 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[XPEAK].getPrecision() + 2; |
---|
| 467 | for(int i=newset[XPEAK].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[XPEAK].widen(); |
---|
| 468 | // Y position of peak flux |
---|
| 469 | val = objectList[obj].getYPeak() + objectList[obj].getYOffset(); |
---|
| 470 | if((val<1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 471 | minval = pow(10, -1. * (newset[YPEAK].getPrecision()+1)); |
---|
| 472 | if(val < minval) newset[YPEAK].upPrec(); |
---|
| 473 | } |
---|
| 474 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[YPEAK].getPrecision() + 2; |
---|
| 475 | for(int i=newset[YPEAK].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[YPEAK].widen(); |
---|
| 476 | // Z position of peak flux |
---|
| 477 | val = objectList[obj].getZPeak() + objectList[obj].getZOffset(); |
---|
| 478 | if((val<1.)&&(val>0.)){ |
---|
| 479 | minval = pow(10, -1. * (newset[ZPEAK].getPrecision()+1)); |
---|
| 480 | if((val>0.)&&(val < minval)) newset[ZPEAK].upPrec(); |
---|
| 481 | } |
---|
| 482 | tempwidth = int( log10(val) + 1) + newset[ZPEAK].getPrecision() + 2; |
---|
| 483 | for(int i=newset[ZPEAK].getWidth();i<tempwidth;i++) newset[ZPEAK].widen(); |
---|
| 484 | } |
---|
[136] | 485 | |
---|
[378] | 486 | return newset; |
---|
[136] | 487 | |
---|
[378] | 488 | } |
---|
[136] | 489 | |
---|
[378] | 490 | std::vector<Col> getLogColSet(std::vector<Detection> &objectList, |
---|
| 491 | FitsHeader &head) |
---|
| 492 | { |
---|
| 493 | /** |
---|
| 494 | * A function that returns a std::vector of Col objects containing |
---|
| 495 | * information on the columns necessary for logfile output: |
---|
| 496 | * Obj#,X,Y,Z,F_tot,F_peak,X1,X2,Y1,Y2,Z1,Z2,Npix |
---|
| 497 | * |
---|
| 498 | * Each object in the provided objectList is checked to see if |
---|
| 499 | * it requires any column to be widened, or for that column to |
---|
| 500 | * have its precision increased. |
---|
| 501 | * |
---|
| 502 | * \param objectList A std::vector list of Detection objects that the columns need to fit. |
---|
| 503 | * \param head The FitsHeader object defining the World Coordinate System. |
---|
| 504 | * \return A std::vector list of Col definitions. |
---|
| 505 | */ |
---|
[136] | 506 | |
---|
[378] | 507 | std::vector<Col> newset,tempset; |
---|
[136] | 508 | |
---|
[378] | 509 | // set up the default columns: |
---|
| 510 | // get from FullColSet, and select only the ones we want. |
---|
| 511 | tempset = getFullColSet(objectList,head); |
---|
[136] | 512 | |
---|
[378] | 513 | newset.push_back( tempset[NUM] ); |
---|
| 514 | newset.push_back( tempset[X] ); |
---|
| 515 | newset.push_back( tempset[Y] ); |
---|
| 516 | newset.push_back( tempset[Z] ); |
---|
| 517 | newset.push_back( tempset[FTOT] ); |
---|
| 518 | newset.push_back( tempset[FPEAK] ); |
---|
| 519 | newset.push_back( tempset[SNRPEAK] ); |
---|
| 520 | newset.push_back( tempset[X1] ); |
---|
| 521 | newset.push_back( tempset[X2] ); |
---|
| 522 | newset.push_back( tempset[Y1] ); |
---|
| 523 | newset.push_back( tempset[Y2] ); |
---|
| 524 | newset.push_back( tempset[Z1] ); |
---|
| 525 | newset.push_back( tempset[Z2] ); |
---|
| 526 | newset.push_back( tempset[NPIX] ); |
---|
[136] | 527 | |
---|
[378] | 528 | return newset; |
---|
[93] | 529 | |
---|
[378] | 530 | } |
---|
| 531 | |
---|
| 532 | } |
---|
| 533 | |
---|
[93] | 534 | } |
---|