| 1 | CFLAGS = -c |
|---|
| 2 | |
|---|
| 3 | FFLAGS = -C -fast -O4 |
|---|
| 4 | |
|---|
| 5 | CC = @CC@ |
|---|
| 6 | CXX = @CXX@ |
|---|
| 7 | F77= @F77@ $(FFLAGS) |
|---|
| 8 | |
|---|
| 9 | BASE = ./src |
|---|
| 10 | |
|---|
| 11 | INSTALLDIR = . |
|---|
| 12 | |
|---|
| 13 | EXEC = Duchamp |
|---|
| 14 | |
|---|
| 15 | PGPLOTINC = @PGPLOTINC@ |
|---|
| 16 | PGPLOTLIB = @PGPLOTLIB@ |
|---|
| 17 | |
|---|
| 18 | CFITSIOINC = @CFITSIOINC@ |
|---|
| 19 | CFITSIOLIB = @CFITSIOLIB@ |
|---|
| 20 | |
|---|
| 21 | WCSINC = @WCSINC@ |
|---|
| 22 | WCSLIB = @WCSLIB@ |
|---|
| 23 | |
|---|
| 24 | CINC = $(PGPLOTINC) $(WCSINC) $(CFITSIOINC) -I$(BASE) |
|---|
| 25 | |
|---|
| 26 | LIBS = @LDFLAGS@ $(WCSLIB) $(CFITSIOLIB) $(PGPLOTLIB) @LIBS@ |
|---|
| 27 | |
|---|
| 28 | ATROUSDIR = $(BASE)/ATrous |
|---|
| 29 | PIXELMAPDIR = $(BASE)/PixelMap |
|---|
| 30 | DETECTIONDIR = $(BASE)/Detection |
|---|
| 31 | CUBESDIR = $(BASE)/Cubes |
|---|
| 32 | FITSIODIR = $(BASE)/FitsIO |
|---|
| 33 | UTILDIR = $(BASE)/Utils |
|---|
| 34 | TESTDIR = ./verification |
|---|
| 35 | |
|---|
| 36 | HEADS = $(BASE)/duchamp.hh\ |
|---|
| 37 | $(BASE)/pgheader.hh\ |
|---|
| 38 | $(BASE)/param.hh\ |
|---|
| 39 | $(BASE)/fitsHeader.hh\ |
|---|
| 40 | $(PIXELMAPDIR)/Voxel.hh\ |
|---|
| 41 | $(PIXELMAPDIR)/Scan.hh\ |
|---|
| 42 | $(PIXELMAPDIR)/Object2D.hh\ |
|---|
| 43 | $(PIXELMAPDIR)/Object3D.hh\ |
|---|
| 44 | $(ATROUSDIR)/atrous.hh\ |
|---|
| 45 | $(ATROUSDIR)/filter.hh\ |
|---|
| 46 | $(DETECTIONDIR)/detection.hh\ |
|---|
| 47 | $(DETECTIONDIR)/columns.hh\ |
|---|
| 48 | $(CUBESDIR)/cubes.hh\ |
|---|
| 49 | $(CUBESDIR)/plots.hh\ |
|---|
| 50 | $(UTILDIR)/Hanning.hh\ |
|---|
| 51 | $(UTILDIR)/GaussSmooth.hh\ |
|---|
| 52 | $(UTILDIR)/Section.hh\ |
|---|
| 53 | $(UTILDIR)/Statistics.hh\ |
|---|
| 54 | $(UTILDIR)/utils.hh\ |
|---|
| 55 | $(UTILDIR)/feedback.hh\ |
|---|
| 56 | $(UTILDIR)/mycpgplot.hh |
|---|
| 57 | |
|---|
| 58 | OBJECTS-NOPG = $(BASE)/mainDuchamp.o \ |
|---|
| 59 | $(BASE)/duchamp.o\ |
|---|
| 60 | $(BASE)/param.o\ |
|---|
| 61 | $(BASE)/fitsHeader.o\ |
|---|
| 62 | $(PIXELMAPDIR)/Voxel.o\ |
|---|
| 63 | $(PIXELMAPDIR)/Scan.o\ |
|---|
| 64 | $(PIXELMAPDIR)/Object2D.o\ |
|---|
| 65 | $(PIXELMAPDIR)/Object3D.o\ |
|---|
| 66 | $(ATROUSDIR)/filter.o\ |
|---|
| 67 | $(ATROUSDIR)/atrous_1d_reconstruct.o\ |
|---|
| 68 | $(ATROUSDIR)/atrous_2d_reconstruct.o\ |
|---|
| 69 | $(ATROUSDIR)/atrous_3d_reconstruct.o\ |
|---|
| 70 | $(ATROUSDIR)/baselineSubtract.o\ |
|---|
| 71 | $(ATROUSDIR)/ReconSearch.o\ |
|---|
| 72 | $(DETECTIONDIR)/detection.o\ |
|---|
| 73 | $(DETECTIONDIR)/columns.o\ |
|---|
| 74 | $(DETECTIONDIR)/areClose.o\ |
|---|
| 75 | $(DETECTIONDIR)/growObject.o\ |
|---|
| 76 | $(DETECTIONDIR)/lutz_detect.o\ |
|---|
| 77 | $(DETECTIONDIR)/mergeIntoList.o\ |
|---|
| 78 | $(DETECTIONDIR)/outputDetection.o\ |
|---|
| 79 | $(DETECTIONDIR)/sorting.o\ |
|---|
| 80 | $(DETECTIONDIR)/spectrumDetect.o\ |
|---|
| 81 | $(CUBESDIR)/cubes.o\ |
|---|
| 82 | $(CUBESDIR)/cubes_extended.o\ |
|---|
| 83 | $(CUBESDIR)/baseline.o\ |
|---|
| 84 | $(CUBESDIR)/CubicSearch.o\ |
|---|
| 85 | $(CUBESDIR)/detectionIO.o\ |
|---|
| 86 | $(CUBESDIR)/getImage.o\ |
|---|
| 87 | $(CUBESDIR)/invertCube.o\ |
|---|
| 88 | $(CUBESDIR)/Merger.o\ |
|---|
| 89 | $(CUBESDIR)/readRecon.o\ |
|---|
| 90 | $(CUBESDIR)/readSmooth.o\ |
|---|
| 91 | $(CUBESDIR)/saveImage.o\ |
|---|
| 92 | $(CUBESDIR)/smoothCube.o\ |
|---|
| 93 | $(CUBESDIR)/trimImage.o\ |
|---|
| 94 | $(FITSIODIR)/dataIO.o\ |
|---|
| 95 | $(FITSIODIR)/headerIO.o\ |
|---|
| 96 | $(FITSIODIR)/subsection.o\ |
|---|
| 97 | $(FITSIODIR)/wcsIO.o\ |
|---|
| 98 | $(UTILDIR)/Section.o\ |
|---|
| 99 | $(UTILDIR)/Statistics.o\ |
|---|
| 100 | $(UTILDIR)/feedback.o\ |
|---|
| 101 | $(UTILDIR)/GaussSmooth.o\ |
|---|
| 102 | $(UTILDIR)/Hanning.o\ |
|---|
| 103 | $(UTILDIR)/getStats.o\ |
|---|
| 104 | $(UTILDIR)/linear_regression.o\ |
|---|
| 105 | $(UTILDIR)/position_related.o\ |
|---|
| 106 | $(UTILDIR)/sort.o\ |
|---|
| 107 | $(UTILDIR)/wcsFunctions.o\ |
|---|
| 108 | $(UTILDIR)/zscale.o |
|---|
| 109 | |
|---|
| 110 | ifeq ($(strip $(PGPLOTLIB)),) |
|---|
| 111 | OBJECTS = $(OBJECTS-NOPG) |
|---|
| 112 | else |
|---|
| 113 | OBJECTS = $(OBJECTS-NOPG)\ |
|---|
| 114 | $(CUBESDIR)/drawBlankEdges.o\ |
|---|
| 115 | $(CUBESDIR)/drawMomentCutout.o\ |
|---|
| 116 | $(CUBESDIR)/outputSpectra.o\ |
|---|
| 117 | $(CUBESDIR)/plotting.o\ |
|---|
| 118 | $(UTILSDIR)/mycpgplot.o\ |
|---|
| 119 | $(CUBESDIR)/plots.o\ |
|---|
| 120 | $(UTILSDIR)/pgplot_related.o |
|---|
| 121 | endif |
|---|
| 122 | |
|---|
| 123 | duchamp : $(OBJECTS) |
|---|
| 124 | $(CXX) -o $(INSTALLDIR)/$(EXEC) $(OBJECTS) $(LIBS) |
|---|
| 125 | |
|---|
| 126 | createTestImage : $(TESTDIR)/createTestImage.o $(UTILDIR)/get_random_spectrum.o |
|---|
| 127 | $(CXX) -o createTestImage.x\ |
|---|
| 128 | $(TESTDIR)/createTestImage.o $(UTILDIR)/get_random_spectrum.o\ |
|---|
| 129 | $(CFITSIOLIB) @LIBS@ |
|---|
| 130 | |
|---|
| 131 | $(OBJECTS) : $(HEADS) |
|---|
| 132 | |
|---|
| 133 | .cc.o: |
|---|
| 134 | $(CXX) -c $< $(CINC) -o $@ |
|---|
| 135 | |
|---|
| 136 | .c.o: |
|---|
| 137 | $(CC) -c $< $(CINC) -o $@ |
|---|
| 138 | |
|---|
| 139 | clean : |
|---|
| 140 | rm -f $(BASE)/*.o $(ATROUSDIR)/*.o $(CUBESDIR)/*.o $(FITSIODIR)/*.o $(DETECTIONDIR)/*.o $(UTILDIR)/*.o $(PIXELMAPDIR)/*.o |
|---|
