Changeset 2610 for trunk/python


Ignore:
Timestamp:
07/30/12 17:06:01 (12 years ago)
Author:
Kana Sugimoto
Message:

New Development: No (an enhancement)

JIRA Issue: Yes (CAS-4146/Trac-276)

Ready for Test: Yes

Interface Changes: No

What Interface Changed:

Test Programs: Interactive tests

Put in Release Notes: Yes

Module(s): scantable, sdbaseline (blfunc='poly'), sdsmooth (kernel!='regrid')

Description:

Implemented a way to exit from verification in the middle of scantable.
Added choises 'a', 'r', and 'h' in actions. Below is the full list of actions.
Available actions of verification [Y|n|a|r]

Y : Yes for current data (default)
N : No for current data
A : Accept all in the following and exit from verification
R : Reject all in the following and exit from verification
H or ?: help (show this message)


File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/python/scantable.py

    r2599 r2610  
    22502250        s._add_history("smooth", varlist)
    22512251
     2252        action = 'H'
    22522253        if plot:
    22532254            from asap.asapplotter import new_asaplot
     
    22632264                xorg=orgscan._getabcissa(r)
    22642265                yorg=orgscan._getspectrum(r)
    2265                 theplot.clear()
    2266                 theplot.hold()
    2267                 theplot.set_axes('ylabel',ylab)
    2268                 theplot.set_axes('xlabel',s._getabcissalabel(r))
    2269                 theplot.set_axes('title',s._getsourcename(r))
    2270                 theplot.set_line(label='Original',color="#777777")
    2271                 theplot.plot(xorg,yorg)
    2272                 theplot.set_line(label='Smoothed',color="red")
    2273                 theplot.plot(xsm,ysm)
    2274                 ### Ugly part for legend
    2275                 for i in [0,1]:
    2276                     theplot.subplots[0]['lines'].append(
    2277                         [theplot.subplots[0]['axes'].lines[i]]
    2278                         )
    2279                 theplot.release()
    2280                 ### Ugly part for legend
    2281                 theplot.subplots[0]['lines']=[]
    2282                 res = raw_input("Accept smoothing ([y]/n): ")
     2266                if action != "N": #skip plotting if rejecting all
     2267                    theplot.clear()
     2268                    theplot.hold()
     2269                    theplot.set_axes('ylabel',ylab)
     2270                    theplot.set_axes('xlabel',s._getabcissalabel(r))
     2271                    theplot.set_axes('title',s._getsourcename(r))
     2272                    theplot.set_line(label='Original',color="#777777")
     2273                    theplot.plot(xorg,yorg)
     2274                    theplot.set_line(label='Smoothed',color="red")
     2275                    theplot.plot(xsm,ysm)
     2276                    ### Ugly part for legend
     2277                    for i in [0,1]:
     2278                        theplot.subplots[0]['lines'].append(
     2279                            [theplot.subplots[0]['axes'].lines[i]]
     2280                            )
     2281                    theplot.release()
     2282                    ### Ugly part for legend
     2283                    theplot.subplots[0]['lines']=[]
     2284                res = self._get_verify_action("Accept smoothing?",action)
     2285                #print "IF%d, POL%d: got result = %s" %(s.getif(r),s.getpol(r),res)
     2286                if r == 0: action = None
     2287                #res = raw_input("Accept smoothing ([y]/n): ")
    22832288                if res.upper() == 'N':
     2289                    # reject for the current rows
    22842290                    s._setspectrum(yorg, r)
     2291                elif res.upper() == 'R':
     2292                    # reject all the following rows
     2293                    action = "N"
     2294                    s._setspectrum(yorg, r)
     2295                elif res.upper() == 'A':
     2296                    # accept all the following rows
     2297                    break
    22852298            theplot.quit()
    22862299            del theplot
     
    29482961                rows = xrange(workscan.nrow())
    29492962                #if len(rows) > 0: workscan._init_blinfo()
    2950                
     2963
     2964                action = "H"
    29512965                for r in rows:
    29522966                    f.x = workscan._getabcissa(r)
     
    29602974                    f.fit()
    29612975
    2962                     f.plot(residual=True)
    2963                     accept_fit = raw_input("Accept fit ( [y]/n ): ")
     2976                    if action != "Y": # skip plotting when accepting all
     2977                        f.plot(residual=True)
     2978                    #accept_fit = raw_input("Accept fit ( [y]/n ): ")
     2979                    #if accept_fit.upper() == "N":
     2980                    #    #workscan._append_blinfo(None, None, None)
     2981                    #    continue
     2982                    accept_fit = self._get_verify_action("Accept fit?",action)
     2983                    if r == 0: action = None
    29642984                    if accept_fit.upper() == "N":
    2965                         #workscan._append_blinfo(None, None, None)
    29662985                        continue
     2986                    elif accept_fit.upper() == "R":
     2987                        break
     2988                    elif accept_fit.upper() == "A":
     2989                        action = "Y"
    29672990                   
    29682991                    blpars = f.get_parameters()
     
    30983121                rows = xrange(workscan.nrow())
    30993122                #if len(rows) > 0: workscan._init_blinfo()
    3100                
     3123
     3124                action = "H"
    31013125                for r in rows:
    31023126                    idx = 2*workscan.getif(r)
     
    31133137                    f.fit()
    31143138
    3115                     f.plot(residual=True)
    3116                     accept_fit = raw_input("Accept fit ( [y]/n ): ")
     3139                    if action != "Y": # skip plotting when accepting all
     3140                        f.plot(residual=True)
     3141                    #accept_fit = raw_input("Accept fit ( [y]/n ): ")
     3142                    accept_fit = self._get_verify_action("Accept fit?",action)
     3143                    if r == 0: action = None
    31173144                    if accept_fit.upper() == "N":
    31183145                        #workscan._append_blinfo(None, None, None)
    31193146                        continue
     3147                    elif accept_fit.upper() == "R":
     3148                        break
     3149                    elif accept_fit.upper() == "A":
     3150                        action = "Y"
    31203151
    31213152                    blpars = f.get_parameters()
     
    36663697            self.set_freqframe(rcParams['scantable.freqframe'])
    36673698
     3699    def _get_verify_action( self, msg, action=None ):
     3700        valid_act = ['Y', 'N', 'A', 'R']
     3701        if not action or not isinstance(action, str):
     3702            action = raw_input("%s [Y/n/a/r] (h for help): " % msg)
     3703        if action == '':
     3704            return "Y"
     3705        elif (action.upper()[0] in valid_act):
     3706            return action.upper()[0]
     3707        elif (action.upper()[0] in ['H','?']):
     3708            print "Available actions of verification [Y|n|a|r]"
     3709            print " Y : Yes for current data (default)"
     3710            print " N : No for current data"
     3711            print " A : Accept all in the following and exit from verification"
     3712            print " R : Reject all in the following and exit from verification"
     3713            print " H or ?: help (show this message)"
     3714            return self._get_verify_action(msg)
     3715        else:
     3716            return 'Y'
    36683717
    36693718    def __getitem__(self, key):
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.