Changeset 1840


Ignore:
Timestamp:
08/03/10 18:34:32 (14 years ago)
Author:
Malte Marquarding
Message:

movde to nose based testing

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/test/test_scantable.py

    r1824 r1840  
    1 import unittest
     1import sys
     2import os
     3import shutil
    24import datetime
    3 from asap import scantable, selector, rcParams, mask_not, asaplog
     5from asap import scantable, selector, mask_not
     6from asap.logging import asaplog
    47asaplog.disable()
    58
    6 class ScantableTest(unittest.TestCase):
    7     def setUp(self):
     9from nose.tools import *
     10
     11def tempdir_setup():
     12    os.makedirs("test_temp")
     13
     14def tempdir_teardown():
     15    shutil.rmtree("test_temp", True)
     16
     17class TestScantable(object):
     18    def setup(self):
    819        s = scantable("data/MOPS.rpf", average=True)
    920        sel = selector()
     
    1728    def test_init(self):
    1829        st = scantable("data/MOPS.rpf", average=False)
    19         self.assertEqual(st.ncycle(), 32)
     30        assert_equal(st.ncycle(), 32)
    2031        st = scantable("data/MOPS.rpf", average=True)
    21         self.assertEqual(st.ncycle(), 2)
     32        assert_equal(st.ncycle(), 2)
    2233        st = scantable("data/MOPS.rpf", unit="Jy")
    23         self.assertEqual(st.get_fluxunit(), "Jy")
     34        assert_equal(st.get_fluxunit(), "Jy")
    2435        st = scantable("data/MOPS.rpf", unit="K")
    25         self.assertEqual(st.get_fluxunit(), "K")
    26         self.assertRaises(RuntimeError, scantable, "data/MOPS.rpf", unit="junk")
     36        assert_equal(st.get_fluxunit(), "K")
     37        assert_raises(RuntimeError, scantable, "data/MOPS.rpf", unit="junk")
    2738        st = scantable(["data/MOPS.rpf","data/MOPS.rpf"], average=False)
    28         self.assertEqual(st.nscan(), 4)
     39        assert_equal(st.nscan(), 4)
    2940
    3041    def test_copy(self):
    3142        st = self.st.copy()
    32         self.assertNotEqual(id(st), id(self.st))
     43        assert_not_equal(id(st), id(self.st))
    3344
    3445    def test_drop_scan(self):
    3546        st = self.st.drop_scan([1])
    36         self.assertEqual(st.nscan(), 1)
     47        assert_equal(st.nscan(), 1)
    3748
    3849    def test_get_scan(self):
    3950        st = self.st.get_scan([1])
    40         self.assertEqual(st.nscan(), 1)
     51        assert_equal(st.nscan(), 1)
    4152        st = self.st.get_scan("Orion_SiO_R")
    42         self.assertEqual(st.get_sourcename()[-1], "Orion_SiO_R")
    43         self.assertEqual(st.nscan(), 1)
     53        assert_equal(st.get_sourcename()[-1], "Orion_SiO_R")
     54        assert_equal(st.nscan(), 1)
    4455
    4556    def test_get_spectrum(self):
    4657        spec = self.st.get_spectrum(0)
    47         self.assertAlmostEqual(max(spec), 215.279830933)
     58        assert_almost_equal(max(spec), 215.279830933)
    4859
    4960    def test_get_mask(self):
    5061        spec = self.st.get_mask(0)
    51         self.assertEqual(len(spec), 4096)
     62        assert_equal(len(spec), 4096)
    5263
    5364    def test_set_spectrum(self):
     
    5566        self.st.set_spectrum(spec, 0)
    5667        spec1 = self.st.get_spectrum(0)
    57         self.assertAlmostEqual(max(spec1), 1.0)
     68        assert_almost_equal(max(spec1), 1.0)
    5869
    5970    def test_selection(self):
     
    6172        sel.set_polarisations("YY")
    6273        self.st.set_selection(sel)
    63         self.assertEqual(self.st.getpolnos(), (1,))
     74        assert_equal(self.st.getpolnos(), (1,))
    6475        sel1 = self.st.get_selection()
    65         self.assertEqual(sel1.get_pols(), [1])
     76        assert_equal(sel1.get_pols(), [1])
    6677        self.st.set_selection(pols="XX")
    67         self.assertEqual(self.st.getpolnos(), (0,))
     78        assert_equal(self.st.getpolnos(), (0,))
    6879
    6980    def test_stats(self):
     
    7687        for k,v in stats.iteritems():
    7788            sval = self.st.stats(stat=k)
    78             self.assertAlmostEqual(sval[0], v)
     89            assert_almost_equal(sval[0], v)
    7990        msk = self.st.create_mask([0,100], [3900,4096])
    80         self.assertAlmostEqual(self.st.stats("sum", msk)[0], 35216.87890625)
     91        assert_almost_equal(self.st.stats("sum", msk)[0], 35216.87890625)
    8192
    8293    def test_get_column_names(self):
     
    90101                  'SRCPROPERMOTION', 'SRCDIRECTION',
    91102                  'SCANRATE']
    92         self.assertEqual(self.st.get_column_names(), cnames)
     103        assert_equal(self.st.get_column_names(), cnames)
    93104
    94105    def test_get_tsys(self):
    95         self.assertAlmostEqual(self.st.get_tsys()[0], 175.830429077)
     106        assert_almost_equal(self.st.get_tsys()[0], 175.830429077)
    96107
    97108    def test_get_time(self):
    98         self.assertEqual(self.st.get_time(0), '2008/03/12/09:32:50')
     109        assert_equal(self.st.get_time(0), '2008/03/12/09:32:50')
    99110        dt = datetime.datetime(2008,3,12,9,32,50)
    100         self.assertEqual(self.st.get_time(0, True), dt)
     111        assert_equal(self.st.get_time(0, True), dt)
    101112
    102113    def test_get_inttime(self):
    103         self.assertAlmostEqual(self.st.get_inttime()[0], 30.720016479)
     114        assert_almost_equal(self.st.get_inttime()[0], 30.720016479)
    104115
    105116    def test_get_sourcename(self):
    106         self.assertEqual(self.st.get_sourcename(0), 'Orion_SiO_R')
    107         self.assertEqual(self.st.get_sourcename(),
     117        assert_equal(self.st.get_sourcename(0), 'Orion_SiO_R')
     118        assert_equal(self.st.get_sourcename(),
    108119                         ['Orion_SiO_R', 'Orion_SiO_R',
    109120                          'Orion_SiO', 'Orion_SiO'])
    110121
    111122    def test_get_azimuth(self):
    112         self.assertAlmostEqual(self.st.get_azimuth()[0], 5.628767013)
     123        assert_almost_equal(self.st.get_azimuth()[0], 5.628767013)
    113124
    114125    def test_get_elevation(self):
    115         self.assertAlmostEqual(self.st.get_elevation()[0], 1.01711678504)
     126        assert_almost_equal(self.st.get_elevation()[0], 1.01711678504)
    116127
    117128    def test_get_parangle(self):
    118         self.assertAlmostEqual(self.st.get_parangle()[0], 2.5921990871)
     129        assert_almost_equal(self.st.get_parangle()[0], 2.5921990871)
    119130
    120131    def test_get_direction(self):
    121         self.assertEqual(self.st.get_direction()[0], '05:35:14.5 -04.52.29.5')
     132        assert_equal(self.st.get_direction()[0], '05:35:14.5 -04.52.29.5')
    122133
    123134    def test_get_directionval(self):
    124135        dv = self.st.get_directionval()[0]
    125         self.assertAlmostEqual(dv[0], 1.4627692699)
    126         self.assertAlmostEqual(dv[1], -0.0850824415)
     136        assert_almost_equal(dv[0], 1.4627692699)
     137        assert_almost_equal(dv[1], -0.0850824415)
    127138
    128139    def test_unit(self):
     
    130141        self.st.set_unit('GHz')
    131142        self.st.set_unit('km/s')
    132         self.assertRaises(RuntimeError, self.st.set_unit, 'junk')
    133         self.assertEquals(self.st.get_unit(), 'km/s')
     143        assert_raises(RuntimeError, self.st.set_unit, 'junk')
     144        assert_equals(self.st.get_unit(), 'km/s')
    134145
    135146    def test_average_pol(self):
    136147        ap = self.st.average_pol()
    137         self.assertEqual(ap.npol(), 1)
     148        assert_equal(ap.npol(), 1)
    138149
    139150    def test_drop_scan(self):
    140151        s0 = self.st.drop_scan(1)
    141         self.assertEqual(s0.getscannos(), (0,))
     152        assert_equal(s0.getscannos(), (0,))
    142153        s1 = self.st.drop_scan([0])
    143         self.assertEqual(s1.getscannos(), (1,))
     154        assert_equal(s1.getscannos(), (1,))
    144155
    145156    def test_flag(self):
     
    151162        q0.flag(mask=mask_not(msk))
    152163        q1.flag(mask=msk)
    153         self.assertAlmostEqual(q0.stats(stat='max')[0], 95.62171936)
    154         self.assertAlmostEqual(q1.stats(stat='max')[0], 2.66563416)
     164        assert_almost_equal(q0.stats(stat='max')[0], 95.62171936)
     165        assert_almost_equal(q1.stats(stat='max')[0], 2.66563416)
    155166
    156 if __name__ == '__main__':
    157     unittest.main()
     167
     168    @with_setup(tempdir_setup, tempdir_teardown)
     169    def test_save(self):
     170        fname = os.path.join("test_temp", 'scantable_test.%s')
     171        formats = [(fname % 'sdfits', 'SDFITS', True),
     172                   (fname % 'ms', 'MS2', True),
     173                   (fname % 'class.fits', 'CLASS', False),
     174                   (fname % 'fits', 'FITS', False),
     175                   (fname % 'txt', 'ASCII', False),
     176                   ]
     177        for format in formats:
     178            yield self.save, format
     179
     180    def save(self, args):
     181        fname = args[0]
     182        self.st.save(fname, args[1], True)
     183        if args[-1]:
     184            s = scantable(fname)
     185            ds = self.st - s
     186            assert_equals(self.st.getpolnos(), s.getpolnos())
     187            assert_equals(self.st.getscannos(), s.getscannos())
     188            assert_equals(self.st.getifnos(), s.getifnos())
     189            assert_equals(self.st.getbeamnos(), s.getbeamnos())
     190            for spec in ds:
     191                assert_almost_equals(sum(spec)/len(spec), 0.0, 5)
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.