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| 2 | // C++ Interface: STMath
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| 4 | // Description:
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| 7 | // Author: Malte Marquarding <asap@atnf.csiro.au>, (C) 2006
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| 9 | // Copyright: See COPYING file that comes with this distribution
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| 12 | #ifndef ASAPSTMATH_H
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| 13 | #define ASAPSTMATH_H
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| 15 | #include <string>
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| 16 | #include <map>
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| 18 | #include <casa/aips.h>
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| 19 | #include <casa/Utilities/CountedPtr.h>
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| 20 | #include <casa/BasicSL/String.h>
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| 21 | #include <casa/Arrays/Vector.h>
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| 22 | #include <scimath/Mathematics/InterpolateArray1D.h>
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| 23 |
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| 24 | #include "Scantable.h"
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| 25 | #include "STDefs.h"
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| 26 | #include "STPol.h"
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| 27 | #include "Logger.h"
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| 29 | namespace asap {
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| 31 | /**
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| 32 | Mathmatical operations on Scantable objects
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| 34 | @author Malte Marquarding
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| 35 | */
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| 36 | class STMath : private Logger {
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| 37 | public:
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| 39 | typedef casa::InterpolateArray1D<casa::Double,
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| 40 | casa::Float>::InterpolationMethod imethod;
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| 41 |
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| 42 | typedef std::map<std::string, imethod> imap;
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| 43 |
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| 44 | STMath(bool insitu=true);
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| 45 |
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| 46 | ~STMath();
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| 47 |
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| 48 | /**
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| 49 | * set the @attr insitu attribute
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| 50 | * @param b
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| 51 | */
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| 52 | bool insitu() const { return insitu_;};
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| 53 | void setInsitu(bool b) { insitu_ = b; };
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| 54 |
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| 55 | casa::CountedPtr<Scantable>
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| 56 | average( const std::vector<casa::CountedPtr<Scantable> >& in,
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| 57 | const std::vector<bool>& mask = std::vector<bool>(),
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| 58 | const std::string& weight = "NONE",
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| 59 | const std::string& avmode = "SCAN",
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| 60 | bool alignfreq = false );
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| 61 |
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| 62 | casa::CountedPtr<Scantable>
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| 63 | unaryOperate( const casa::CountedPtr<Scantable>& in, float val,
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| 64 | const std::string& mode, bool tsys=false );
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| 65 |
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| 66 | casa::CountedPtr<Scantable> quotient( const casa::CountedPtr<Scantable>& in,
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| 67 | const std::string& mode = "NEAREST",
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| 68 | bool preserve = true );
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| 69 |
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| 70 | casa::CountedPtr<Scantable>
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| 71 | freqSwitch( const casa::CountedPtr<Scantable>& in );
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| 72 |
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| 73 | std::vector<float> statistic(const casa::CountedPtr<Scantable>& in,
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| 74 | const std::vector<bool>& mask,
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| 75 | const std::string& which);
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| 76 |
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| 77 | casa::CountedPtr<Scantable> bin( const casa::CountedPtr<Scantable>& in,
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| 78 | int width=5);
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| 79 | casa::CountedPtr<Scantable>
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| 80 | resample(const casa::CountedPtr<Scantable>& in,
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| 81 | const std::string& method, float width);
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| 82 |
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| 83 | casa::CountedPtr<Scantable>
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| 84 | smooth(const casa::CountedPtr<Scantable>& in, const std::string& kernel,
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| 85 | float width);
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| 86 |
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| 87 | casa::CountedPtr<Scantable>
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| 88 | gainElevation(const casa::CountedPtr<Scantable>& in,
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| 89 | const std::vector<float>& coeff,
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| 90 | const std::string& fileName,
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| 91 | const std::string& method);
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| 92 | casa::CountedPtr<Scantable>
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| 93 | convertFlux(const casa::CountedPtr<Scantable>& in, float d,
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| 94 | float etaap, float jyperk);
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| 95 |
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| 96 | casa::CountedPtr<Scantable> opacity(const casa::CountedPtr<Scantable>& in,
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| 97 | float tau);
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| 98 |
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| 99 | casa::CountedPtr<Scantable>
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| 100 | merge(const std::vector<casa::CountedPtr<Scantable> >& in);
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| 101 |
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| 102 | casa::CountedPtr<Scantable>
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| 103 | invertPhase( const casa::CountedPtr<Scantable>& in);
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| 104 |
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| 105 | casa::CountedPtr<Scantable>
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| 106 | rotateXYPhase( const casa::CountedPtr<Scantable>& in, float phase);
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| 107 |
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| 108 | casa::CountedPtr<Scantable>
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| 109 | rotateLinPolPhase( const casa::CountedPtr<Scantable>& in, float phase);
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| 110 |
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| 111 | /// @todo frequency alignment
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| 112 |
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| 113 | casa::CountedPtr<Scantable>
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| 114 | swapPolarisations(const casa::CountedPtr<Scantable>& in);
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| 115 |
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| 116 | casa::CountedPtr<Scantable>
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| 117 | frequencyAlign( const casa::CountedPtr<Scantable>& in,
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| 118 | const std::string& refTime = "",
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| 119 | const std::string& method = "cubic" );
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| 120 |
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| 121 | private:
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| 122 | casa::CountedPtr<Scantable> applyToPol( const casa::CountedPtr<Scantable>& in,
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| 123 | STPol::polOperation fptr,
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| 124 | casa::Float phase);
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| 125 |
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| 126 | static imethod stringToIMethod(const std::string& in);
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| 127 | static WeightType stringToWeight(const std::string& in);
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| 128 |
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| 129 | void scaleByVector(casa::Table& in,
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| 130 | const casa::Vector<casa::Float>& factor,
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| 131 | bool dotsys);
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| 132 |
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| 133 | void scaleFromAsciiTable(casa::Table& in, const std::string& filename,
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| 134 | const std::string& method,
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| 135 | const casa::Vector<casa::Float>& xout,
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| 136 | bool dotsys);
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| 137 |
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| 138 | void scaleFromTable(casa::Table& in, const casa::Table& table,
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| 139 | const std::string& method,
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| 140 | const casa::Vector<casa::Float>& xout, bool dotsys);
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| 141 |
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| 142 | void convertBrightnessUnits(casa::CountedPtr<Scantable>& in,
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| 143 | bool tokelvin, float cfac);
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| 144 |
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| 145 | casa::CountedPtr< Scantable >
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| 146 | getScantable(const casa::CountedPtr< Scantable >& in, bool droprows);
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| 147 |
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| 148 | casa::MaskedArray<casa::Float>
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| 149 | maskedArray( const casa::Vector<casa::Float>& s,
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| 150 | const casa::Vector<casa::uChar>& f );
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| 151 | casa::Vector<casa::uChar>
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| 152 | flagsFromMA(const casa::MaskedArray<casa::Float>& ma);
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| 153 |
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| 154 | bool insitu_;
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| 155 | };
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| 156 |
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| 157 | }
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| 158 | #endif
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