1 | //
|
---|
2 | // C++ Implementation: STCalSkyOtfAlma
|
---|
3 | //
|
---|
4 | // Description:
|
---|
5 | //
|
---|
6 | //
|
---|
7 | // Author: Takeshi Nakazato <takeshi.nakazato@nao.ac.jp> (C) 2012
|
---|
8 | //
|
---|
9 | // Copyright: See COPYING file that comes with this distribution
|
---|
10 | //
|
---|
11 | //
|
---|
12 |
|
---|
13 | #include <vector>
|
---|
14 | #include "STSelector.h"
|
---|
15 | #include "STCalSkyOtfAlma.h"
|
---|
16 | #include "RowAccumulator.h"
|
---|
17 | #include "STIdxIter.h"
|
---|
18 | #include "STDefs.h"
|
---|
19 | #include "EdgeMarker.h"
|
---|
20 |
|
---|
21 | #include <atnf/PKSIO/SrcType.h>
|
---|
22 |
|
---|
23 | using namespace std;
|
---|
24 | using namespace casa;
|
---|
25 |
|
---|
26 | namespace asap {
|
---|
27 | STCalSkyOtfAlma::STCalSkyOtfAlma(CountedPtr<Scantable> &s, bool israster)
|
---|
28 | : STCalSkyPSAlma(s),
|
---|
29 | israster_(israster)
|
---|
30 | {}
|
---|
31 |
|
---|
32 | void STCalSkyOtfAlma::setupSelector()
|
---|
33 | {
|
---|
34 | sel_.reset();
|
---|
35 |
|
---|
36 | // Detect edges using EdgeMarker
|
---|
37 | EdgeMarker marker(israster_);
|
---|
38 |
|
---|
39 | // we can set insitu=True since we only need
|
---|
40 | // a list of rows to be marked. No marking is
|
---|
41 | // done here.
|
---|
42 | marker.setdata(scantable_, True);
|
---|
43 | marker.setoption(options_);
|
---|
44 | marker.detect();
|
---|
45 | Block<uInt> rows = marker.getDetectedRows();
|
---|
46 | vector<int> vectorRows(rows.nelements());
|
---|
47 | for (size_t i = 0; i < vectorRows.size(); ++i)
|
---|
48 | vectorRows[i] = rows[i];
|
---|
49 |
|
---|
50 | // Set list of row indices to selector
|
---|
51 | sel_.setRows(vectorRows);
|
---|
52 | }
|
---|
53 |
|
---|
54 | // void STCalSkyOtfAlma::fillCalTable()
|
---|
55 | // {
|
---|
56 | // RowAccumulator acc(W_TINT);
|
---|
57 |
|
---|
58 | // vector<string> cols(3);
|
---|
59 | // cols[0] = "IFNO";
|
---|
60 | // cols[1] = "POLNO";
|
---|
61 | // cols[2] = "BEAMNO";
|
---|
62 | // STIdxIterAcc iter(scantable_, cols);
|
---|
63 |
|
---|
64 | // ROScalarColumn<Double> *tcol = new ROScalarColumn<Double>(scantable_->table(), "TIME");
|
---|
65 | // Vector<Double> timeSec = tcol->getColumn() * 86400.0;
|
---|
66 | // tcol->attach(scantable_->table(), "INTERVAL");
|
---|
67 | // Vector<Double> intervalSec = tcol->getColumn();
|
---|
68 | // delete tcol;
|
---|
69 | // ROScalarColumn<Float> *ecol = new ROScalarColumn<Float>(scantable_->table(), "ELEVATION");
|
---|
70 | // Vector<Float> elevation = ecol->getColumn();
|
---|
71 | // delete ecol;
|
---|
72 |
|
---|
73 | // ROArrayColumn<Float> specCol(scantable_->table(), "SPECTRA");
|
---|
74 | // ROArrayColumn<uChar> flagCol(scantable_->table(), "FLAGTRA");
|
---|
75 | // ROScalarColumn<uInt> freqidCol(scantable_->table(), "FREQ_ID");
|
---|
76 |
|
---|
77 | // // dummy Tsys: the following process doesn't need Tsys but RowAccumulator
|
---|
78 | // // requires to set it with spectral data
|
---|
79 | // Vector<Float> tsys(1, 1.0);
|
---|
80 |
|
---|
81 | // Double timeCen = 0.0;
|
---|
82 | // Float elCen = 0.0;
|
---|
83 | // uInt count = 0;
|
---|
84 |
|
---|
85 | // while(!iter.pastEnd()) {
|
---|
86 | // Vector<uInt> rows = iter.getRows(SHARE);
|
---|
87 | // Vector<uInt> current = iter.current();
|
---|
88 | // uInt len = rows.nelements();
|
---|
89 | // if (len == 0) {
|
---|
90 | // iter.next();
|
---|
91 | // continue;
|
---|
92 | // }
|
---|
93 | // else if (len == 1) {
|
---|
94 | // STCalSkyTable *p = dynamic_cast<STCalSkyTable *>(&(*applytable_));
|
---|
95 | // uInt irow = rows[0];
|
---|
96 | // p->appenddata(0, 0, current[2], current[0], current[1],
|
---|
97 | // freqidCol(irow), timeSec[irow], elevation[irow], specCol(irow));
|
---|
98 | // iter.next();
|
---|
99 | // continue;
|
---|
100 | // }
|
---|
101 |
|
---|
102 | // uInt nchan = scantable_->nchan(scantable_->getIF(rows[0]));
|
---|
103 | // Vector<uChar> flag(nchan);
|
---|
104 | // Vector<Bool> bflag(nchan);
|
---|
105 | // Vector<Float> spec(nchan);
|
---|
106 |
|
---|
107 | // Vector<Double> timeSep(len);
|
---|
108 | // for (uInt i = 0; i < len-1; i++) {
|
---|
109 | // timeSep[i] = timeSec[rows[i+1]] - timeSec[rows[i]] ;
|
---|
110 | // }
|
---|
111 | // Double tMedian = median(timeSep(IPosition(1,0), IPosition(1,len-2)));
|
---|
112 | // timeSep[len-1] = tMedian * 10000.0 ; // any large value
|
---|
113 |
|
---|
114 | // uInt irow ;
|
---|
115 | // uInt jrow ;
|
---|
116 | // for (uInt i = 0; i < len; i++) {
|
---|
117 | // irow = rows[i];
|
---|
118 | // jrow = (i < len-1) ? rows[i+1] : rows[i];
|
---|
119 | // // accumulate data
|
---|
120 | // flagCol.get(irow, flag);
|
---|
121 | // convertArray(bflag, flag);
|
---|
122 | // specCol.get(irow, spec);
|
---|
123 | // if ( !allEQ(bflag,True) )
|
---|
124 | // acc.add( spec, !bflag, tsys, intervalSec[irow], timeSec[irow] ) ;
|
---|
125 | // timeCen += timeSec[irow];
|
---|
126 | // elCen += elevation[irow];
|
---|
127 | // count++;
|
---|
128 |
|
---|
129 | // // check time gap
|
---|
130 | // double gap = 2.0 * timeSep[i] / (intervalSec[jrow] + intervalSec[irow]);
|
---|
131 | // if ( gap > 1.1 ) {
|
---|
132 | // if ( acc.state() ) {
|
---|
133 | // acc.replaceNaN() ;
|
---|
134 | // // const Vector<Bool> &msk = acc.getMask();
|
---|
135 | // // convertArray(flag, !msk);
|
---|
136 | // // for (uInt k = 0; k < nchan; ++k) {
|
---|
137 | // // uChar userFlag = 1 << 7;
|
---|
138 | // // if (msk[k]==True) userFlag = 0 << 7;
|
---|
139 | // // flag(k) = userFlag;
|
---|
140 | // // }
|
---|
141 | // timeCen /= (Double)count * 86400.0; // sec->day
|
---|
142 | // elCen /= (Float)count;
|
---|
143 | // STCalSkyTable *p = dynamic_cast<STCalSkyTable *>(&(*applytable_));
|
---|
144 | // p->appenddata(0, 0, current[2], current[0], current[1],
|
---|
145 | // freqidCol(irow), timeCen, elCen, acc.getSpectrum());
|
---|
146 | // }
|
---|
147 | // acc.reset() ;
|
---|
148 | // timeCen = 0.0;
|
---|
149 | // elCen = 0.0;
|
---|
150 | // count = 0;
|
---|
151 | // }
|
---|
152 | // }
|
---|
153 |
|
---|
154 | // iter.next() ;
|
---|
155 | // }
|
---|
156 | // }
|
---|
157 |
|
---|
158 | }
|
---|