1 | // |
---|
2 | // C++ Implementation: STCalSkyOtfAlma |
---|
3 | // |
---|
4 | // Description: |
---|
5 | // |
---|
6 | // |
---|
7 | // Author: Takeshi Nakazato <takeshi.nakazato@nao.ac.jp> (C) 2012 |
---|
8 | // |
---|
9 | // Copyright: See COPYING file that comes with this distribution |
---|
10 | // |
---|
11 | // |
---|
12 | |
---|
13 | #include <vector> |
---|
14 | #include "STSelector.h" |
---|
15 | #include "STCalSkyOtfAlma.h" |
---|
16 | #include "RowAccumulator.h" |
---|
17 | #include "STIdxIter.h" |
---|
18 | #include "STDefs.h" |
---|
19 | #include "EdgeMarker.h" |
---|
20 | |
---|
21 | #include <atnf/PKSIO/SrcType.h> |
---|
22 | |
---|
23 | using namespace std; |
---|
24 | using namespace casa; |
---|
25 | |
---|
26 | namespace asap { |
---|
27 | STCalSkyOtfAlma::STCalSkyOtfAlma(CountedPtr<Scantable> &s, bool israster) |
---|
28 | : STCalSkyPSAlma(s), |
---|
29 | israster_(israster) |
---|
30 | {} |
---|
31 | |
---|
32 | void STCalSkyOtfAlma::setupSelector() |
---|
33 | { |
---|
34 | sel_.reset(); |
---|
35 | |
---|
36 | // Detect edges using EdgeMarker |
---|
37 | EdgeMarker marker(israster_); |
---|
38 | |
---|
39 | // we can set insitu=True since we only need |
---|
40 | // a list of rows to be marked. No marking is |
---|
41 | // done here. |
---|
42 | marker.setdata(scantable_, True); |
---|
43 | marker.setoption(options_); |
---|
44 | marker.detect(); |
---|
45 | Block<uInt> rows = marker.getDetectedRows(); |
---|
46 | vector<int> vectorRows(rows.nelements()); |
---|
47 | for (size_t i = 0; i < vectorRows.size(); ++i) |
---|
48 | vectorRows[i] = rows[i]; |
---|
49 | |
---|
50 | // Set list of row indices to selector |
---|
51 | sel_.setRows(vectorRows); |
---|
52 | } |
---|
53 | |
---|
54 | // void STCalSkyOtfAlma::fillCalTable() |
---|
55 | // { |
---|
56 | // RowAccumulator acc(W_TINT); |
---|
57 | |
---|
58 | // vector<string> cols(3); |
---|
59 | // cols[0] = "IFNO"; |
---|
60 | // cols[1] = "POLNO"; |
---|
61 | // cols[2] = "BEAMNO"; |
---|
62 | // STIdxIterAcc iter(scantable_, cols); |
---|
63 | |
---|
64 | // ROScalarColumn<Double> *tcol = new ROScalarColumn<Double>(scantable_->table(), "TIME"); |
---|
65 | // Vector<Double> timeSec = tcol->getColumn() * 86400.0; |
---|
66 | // tcol->attach(scantable_->table(), "INTERVAL"); |
---|
67 | // Vector<Double> intervalSec = tcol->getColumn(); |
---|
68 | // delete tcol; |
---|
69 | // ROScalarColumn<Float> *ecol = new ROScalarColumn<Float>(scantable_->table(), "ELEVATION"); |
---|
70 | // Vector<Float> elevation = ecol->getColumn(); |
---|
71 | // delete ecol; |
---|
72 | |
---|
73 | // ROArrayColumn<Float> specCol(scantable_->table(), "SPECTRA"); |
---|
74 | // ROArrayColumn<uChar> flagCol(scantable_->table(), "FLAGTRA"); |
---|
75 | // ROScalarColumn<uInt> freqidCol(scantable_->table(), "FREQ_ID"); |
---|
76 | |
---|
77 | // // dummy Tsys: the following process doesn't need Tsys but RowAccumulator |
---|
78 | // // requires to set it with spectral data |
---|
79 | // Vector<Float> tsys(1, 1.0); |
---|
80 | |
---|
81 | // Double timeCen = 0.0; |
---|
82 | // Float elCen = 0.0; |
---|
83 | // uInt count = 0; |
---|
84 | |
---|
85 | // while(!iter.pastEnd()) { |
---|
86 | // Vector<uInt> rows = iter.getRows(SHARE); |
---|
87 | // Vector<uInt> current = iter.current(); |
---|
88 | // uInt len = rows.nelements(); |
---|
89 | // if (len == 0) { |
---|
90 | // iter.next(); |
---|
91 | // continue; |
---|
92 | // } |
---|
93 | // else if (len == 1) { |
---|
94 | // STCalSkyTable *p = dynamic_cast<STCalSkyTable *>(&(*applytable_)); |
---|
95 | // uInt irow = rows[0]; |
---|
96 | // p->appenddata(0, 0, current[2], current[0], current[1], |
---|
97 | // freqidCol(irow), timeSec[irow], elevation[irow], specCol(irow)); |
---|
98 | // iter.next(); |
---|
99 | // continue; |
---|
100 | // } |
---|
101 | |
---|
102 | // uInt nchan = scantable_->nchan(scantable_->getIF(rows[0])); |
---|
103 | // Vector<uChar> flag(nchan); |
---|
104 | // Vector<Bool> bflag(nchan); |
---|
105 | // Vector<Float> spec(nchan); |
---|
106 | |
---|
107 | // Vector<Double> timeSep(len); |
---|
108 | // for (uInt i = 0; i < len-1; i++) { |
---|
109 | // timeSep[i] = timeSec[rows[i+1]] - timeSec[rows[i]] ; |
---|
110 | // } |
---|
111 | // Double tMedian = median(timeSep(IPosition(1,0), IPosition(1,len-2))); |
---|
112 | // timeSep[len-1] = tMedian * 10000.0 ; // any large value |
---|
113 | |
---|
114 | // uInt irow ; |
---|
115 | // uInt jrow ; |
---|
116 | // for (uInt i = 0; i < len; i++) { |
---|
117 | // irow = rows[i]; |
---|
118 | // jrow = (i < len-1) ? rows[i+1] : rows[i]; |
---|
119 | // // accumulate data |
---|
120 | // flagCol.get(irow, flag); |
---|
121 | // convertArray(bflag, flag); |
---|
122 | // specCol.get(irow, spec); |
---|
123 | // if ( !allEQ(bflag,True) ) |
---|
124 | // acc.add( spec, !bflag, tsys, intervalSec[irow], timeSec[irow] ) ; |
---|
125 | // timeCen += timeSec[irow]; |
---|
126 | // elCen += elevation[irow]; |
---|
127 | // count++; |
---|
128 | |
---|
129 | // // check time gap |
---|
130 | // double gap = 2.0 * timeSep[i] / (intervalSec[jrow] + intervalSec[irow]); |
---|
131 | // if ( gap > 1.1 ) { |
---|
132 | // if ( acc.state() ) { |
---|
133 | // acc.replaceNaN() ; |
---|
134 | // // const Vector<Bool> &msk = acc.getMask(); |
---|
135 | // // convertArray(flag, !msk); |
---|
136 | // // for (uInt k = 0; k < nchan; ++k) { |
---|
137 | // // uChar userFlag = 1 << 7; |
---|
138 | // // if (msk[k]==True) userFlag = 0 << 7; |
---|
139 | // // flag(k) = userFlag; |
---|
140 | // // } |
---|
141 | // timeCen /= (Double)count * 86400.0; // sec->day |
---|
142 | // elCen /= (Float)count; |
---|
143 | // STCalSkyTable *p = dynamic_cast<STCalSkyTable *>(&(*applytable_)); |
---|
144 | // p->appenddata(0, 0, current[2], current[0], current[1], |
---|
145 | // freqidCol(irow), timeCen, elCen, acc.getSpectrum()); |
---|
146 | // } |
---|
147 | // acc.reset() ; |
---|
148 | // timeCen = 0.0; |
---|
149 | // elCen = 0.0; |
---|
150 | // count = 0; |
---|
151 | // } |
---|
152 | // } |
---|
153 | |
---|
154 | // iter.next() ; |
---|
155 | // } |
---|
156 | // } |
---|
157 | |
---|
158 | } |
---|