source: trunk/src/MSFiller.h @ 2237

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New Development: No

JIRA Issue: No

Ready for Test: Yes

Interface Changes: No

What Interface Changed: Please list interface changes

Test Programs: List test programs

Put in Release Notes: Yes/No?

Module(s): Module Names change impacts.

Description: Describe your changes here...

Refactoring MSFiller::fill() to detect bottle neck of the process.
There are no changes effectively.


File size: 6.5 KB
Line 
1//
2// C++ Interface: MSFiller
3//
4// Description:
5//
6// This class is specific filler for MS format
7//
8// Takeshi Nakazato <takeshi.nakazato@nao.ac.jp>, (C) 2010
9//
10// Copyright: See COPYING file that comes with this distribution
11//
12//
13#ifndef ASAPMSFILLER_H
14#define ASAPMSFILLER_H
15
16// STL
17#include <string>
18
19// Boost
20#include <boost/pool/object_pool.hpp>
21
22// AIPS++
23#include <casa/aips.h>
24#include <casa/Utilities/CountedPtr.h>
25#include <casa/Arrays/Vector.h>
26#include <casa/Arrays/Matrix.h>
27#include <casa/Arrays/Cube.h>
28#include <casa/Logging/LogIO.h>
29
30#include <casa/Containers/Record.h>
31#include <casa/Containers/Block.h>
32
33//#include <tables/Tables/TableColumn.h>
34
35#include <ms/MeasurementSets/MeasurementSet.h>
36#include <ms/MeasurementSets/MSPointing.h>
37
38#include "Scantable.h"
39
40namespace asap
41{
42
43class MSFiller
44{
45public:
46  explicit MSFiller(casa::CountedPtr<Scantable> stable) ;
47  virtual ~MSFiller() ;
48 
49  virtual bool open(const std::string& filename, const casa::Record& rec) ;
50  virtual void fill() ;
51  virtual void close() ;
52 
53protected:
54 
55 
56private:
57 
58  MSFiller();
59  MSFiller(const MSFiller&);
60  MSFiller& operator=(const MSFiller&);
61
62  // fill subtables
63  //void fillFrequencies() ;
64  //void fillMolecules() ;
65  void fillWeather() ;
66  void fillFocus() ;
67  //void fillHistory() ;
68  //void fillFit() ;
69  void fillTcal( boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *poolr ) ;
70
71  // get SRCTYPE from STATE_ID
72  casa::Int getSrcType( casa::Int stateId, boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
73
74  // get POLNO from CORR_TYPE
75  casa::Block<casa::uInt> getPolNo( casa::Int corrType ) ;
76
77  // get poltype from CORR_TYPE
78  casa::String getPolType( casa::Int corrType ) ;
79
80  // get WEATHER_ID
81  casa::uInt getWeatherId( casa::uInt idx, casa::Double wtime ) ;
82
83  // get time stamp in SYSCAL table
84  // assume that tab is selected by ANTENNA_ID, FEED_ID, SPECTRAL_WINDOW_ID
85  // and sorted by TIME
86  void getSysCalTime( casa::Vector<casa::MEpoch> &scTimeIn, casa::Vector<casa::Double> &scInterval, casa::Block<casa::MEpoch> &tcol, casa::Block<casa::Int> &tidx ) ;
87
88  // get TCAL_ID
89  casa::Block<casa::uInt> getTcalId( casa::Int feedId, casa::Int spwId, casa::MEpoch &t ) ;
90
91  // get direction for DIRECTION, AZIMUTH, and ELEVATION columns
92  casa::uInt getDirection( casa::uInt idx, casa::Vector<casa::Double> &dir, casa::Vector<casa::Double> &srate, casa::String &ref, casa::MSPointing &tab, casa::Double t ) ;
93  casa::uInt getDirection( casa::uInt idx, casa::Vector<casa::Double> &dir, casa::Vector<casa::Double> &azel, casa::Vector<casa::Double> &srate, casa::MSPointing &tab, casa::MEpoch &t, casa::MPosition &antpos ) ;
94  void getSourceDirection( casa::Vector<casa::Double> &dir, casa::Vector<casa::Double> &azel, casa::Vector<casa::Double> &srate, casa::MEpoch &t, casa::MPosition &antpos, casa::Vector<casa::MDirection> &srcdir ) ;
95
96  // create key for TCAL table
97  casa::String keyTcal( casa::Int feedid, casa::Int spwid, casa::String stime ) ;
98
99  // binary search
100  casa::uInt binarySearch( casa::Vector<casa::MEpoch> &timeList, casa::Double target ) ;
101
102  // tool for HPC
103  double gettimeofday_sec() ;
104
105  // get frequency frame
106  std::string getFrame() ;
107
108  // reshape SPECTRA and FLAGTRA
109  void reshapeSpectraAndFlagtra( casa::Cube<casa::Float> &sp,
110                                 casa::Cube<casa::Bool> &fl,
111                                 casa::Table &tab,
112                                 casa::Int &npol,
113                                 casa::Int &nchan,
114                                 casa::Int &nrow,
115                                 casa::Vector<casa::Int> &corrtype ) ;
116 
117  // initialize header
118  void initHeader( STHeader &header ) ;
119
120  // get value from table column using object pool
121  casa::String asString( casa::String name,
122                         casa::uInt idx,
123                         casa::Table tab,
124                         boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
125  casa::Bool asBool( casa::String name,
126                     casa::uInt idx,
127                     casa::Table &tab,
128                     boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
129  casa::Int asInt( casa::String name,
130                   casa::uInt idx,
131                   casa::Table &tab,
132                   boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
133  casa::uInt asuInt( casa::String name,
134                     casa::uInt idx,
135                     casa::Table &tab,
136                     boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
137  casa::Float asFloat( casa::String name,
138                       casa::uInt idx,
139                       casa::Table &tab,
140                       boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
141  casa::Double asDouble( casa::String name,
142                         casa::uInt idx,
143                         casa::Table &tab,
144                         boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
145
146  void sourceInfo( casa::Int sourceId,
147                   casa::Int spwId,
148                   casa::String &name,
149                   casa::MDirection &direction,
150                   casa::Vector<casa::Double> &properMotion,
151                   casa::Vector<casa::Double> &restFreqs,
152                   casa::Vector<casa::String> &transitions,
153                   casa::Vector<casa::Double> &sysVels,
154                   boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
155
156  void spectralSetup( casa::Int spwId,
157                      casa::MEpoch &me,
158                      casa::MPosition &mp,
159                      casa::MDirection &md,
160                      casa::Double &refpix,
161                      casa::Double &refval,
162                      casa::Double &increment,
163                      casa::Int &nchan,
164                      casa::String &freqref,
165                      casa::Double &reffreq,
166                      casa::Double &bandwidth,
167                      boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
168
169  casa::CountedPtr<Scantable> table_ ;
170  casa::MeasurementSet mstable_ ;
171  casa::String tablename_ ;
172  casa::Int antenna_ ;
173  casa::String antennaStr_ ;
174  casa::Bool getPt_ ;
175
176  casa::Bool isFloatData_ ;
177  casa::Bool isData_ ;
178
179  casa::Bool isDoppler_ ;
180  casa::Bool isFlagCmd_ ;
181  casa::Bool isFreqOffset_ ;
182  casa::Bool isHistory_ ;
183  casa::Bool isProcessor_ ;
184  casa::Bool isSysCal_ ;
185  casa::Bool isWeather_ ;
186
187  casa::String colTsys_ ;
188  casa::String colTcal_ ;
189
190  casa::LogIO os_ ;
191 
192  casa::Vector<casa::Double> mwTime_ ;
193  casa::Vector<casa::Double> mwInterval_ ;
194  casa::Vector<casa::uInt> mwIndex_ ;
195
196  // Record for TCAL_ID
197  // "FIELD0": "SPW0": Vector<uInt>
198  //           "SPW1": Vector<uInt>
199  //  ...
200  casa::Record tcalrec_ ;
201
202  //casa::ROTableColumn *scCol_ ;
203};
204
205
206};
207#endif
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.