| 1 | CFLAGS = -O2 -ftree-vectorize |
|---|
| 2 | |
|---|
| 3 | FFLAGS = -C -fast -O4 |
|---|
| 4 | |
|---|
| 5 | CC = gcc $(CFLAGS) |
|---|
| 6 | CXX = g++ $(CFLAGS) |
|---|
| 7 | F77= gfortran $(FFLAGS) |
|---|
| 8 | LINK= gfortran |
|---|
| 9 | |
|---|
| 10 | BASE = ./src |
|---|
| 11 | |
|---|
| 12 | INSTALLDIR = /usr/local/bin |
|---|
| 13 | LIBDIR = /usr/local/lib |
|---|
| 14 | INCDIR = /usr/local/include/duchamp |
|---|
| 15 | |
|---|
| 16 | V = 1.1.10 |
|---|
| 17 | EXEC = Duchamp-$(V) |
|---|
| 18 | EXEC-STUB = Duchamp |
|---|
| 19 | |
|---|
| 20 | AR = ar cq |
|---|
| 21 | LIB = libduchamp.a |
|---|
| 22 | RANLIB = ranlib |
|---|
| 23 | |
|---|
| 24 | INSTALL = install |
|---|
| 25 | LN_S = ln -s |
|---|
| 26 | |
|---|
| 27 | PGPLOTINC = -I/opt/local/include |
|---|
| 28 | PGPLOTLIB = -L/opt/local/lib -lcpgplot -lpgplot -L/usr/X11/lib -R/usr/X11/lib -lSM -lICE -lX11 -lz -lpng -lstdc++ -lm -bind_at_load |
|---|
| 29 | |
|---|
| 30 | CFITSIOINC = -I/opt/local/include |
|---|
| 31 | CFITSIOLIB = -L/opt/local/lib -lcfitsio |
|---|
| 32 | |
|---|
| 33 | WCSINC = -I/usr/local/include -I/usr/local/include/wcslib |
|---|
| 34 | WCSLIB = -L/usr/local/lib -lwcs -lpgsbox |
|---|
| 35 | |
|---|
| 36 | CINC = $(PGPLOTINC) $(WCSINC) $(CFITSIOINC) -I$(BASE) |
|---|
| 37 | |
|---|
| 38 | LIBS = $(WCSLIB) $(CFITSIOLIB) $(PGPLOTLIB) |
|---|
| 39 | |
|---|
| 40 | ATROUSDIR = $(BASE)/ATrous |
|---|
| 41 | PIXELMAPDIR = $(BASE)/PixelMap |
|---|
| 42 | DETECTIONDIR = $(BASE)/Detection |
|---|
| 43 | CUBESDIR = $(BASE)/Cubes |
|---|
| 44 | FITSIODIR = $(BASE)/FitsIO |
|---|
| 45 | UTILDIR = $(BASE)/Utils |
|---|
| 46 | TESTDIR = ./verification |
|---|
| 47 | |
|---|
| 48 | HEADS = $(BASE)/duchamp.hh\ |
|---|
| 49 | $(BASE)/pgheader.hh\ |
|---|
| 50 | $(BASE)/param.hh\ |
|---|
| 51 | $(BASE)/fitsHeader.hh\ |
|---|
| 52 | $(PIXELMAPDIR)/Voxel.hh\ |
|---|
| 53 | $(PIXELMAPDIR)/Scan.hh\ |
|---|
| 54 | $(PIXELMAPDIR)/Object2D.hh\ |
|---|
| 55 | $(PIXELMAPDIR)/Object3D.hh\ |
|---|
| 56 | $(ATROUSDIR)/atrous.hh\ |
|---|
| 57 | $(ATROUSDIR)/filter.hh\ |
|---|
| 58 | $(DETECTIONDIR)/detection.hh\ |
|---|
| 59 | $(DETECTIONDIR)/columns.hh\ |
|---|
| 60 | $(DETECTIONDIR)/finders.hh\ |
|---|
| 61 | $(DETECTIONDIR)/ObjectGrower.hh\ |
|---|
| 62 | $(CUBESDIR)/cubes.hh\ |
|---|
| 63 | $(CUBESDIR)/plots.hh\ |
|---|
| 64 | $(CUBESDIR)/VOTable.hh\ |
|---|
| 65 | $(UTILDIR)/Hanning.hh\ |
|---|
| 66 | $(UTILDIR)/GaussSmooth1D.hh\ |
|---|
| 67 | $(UTILDIR)/GaussSmooth2D.hh\ |
|---|
| 68 | $(UTILDIR)/Section.hh\ |
|---|
| 69 | $(UTILDIR)/Statistics.hh\ |
|---|
| 70 | $(UTILDIR)/utils.hh\ |
|---|
| 71 | $(UTILDIR)/feedback.hh\ |
|---|
| 72 | $(UTILDIR)/mycpgplot.hh |
|---|
| 73 | |
|---|
| 74 | OBJECTS-NOPG = $(BASE)/mainDuchamp.o \ |
|---|
| 75 | $(BASE)/duchamp.o\ |
|---|
| 76 | $(BASE)/param.o\ |
|---|
| 77 | $(BASE)/fitsHeader.o\ |
|---|
| 78 | $(PIXELMAPDIR)/Voxel.o\ |
|---|
| 79 | $(PIXELMAPDIR)/Scan.o\ |
|---|
| 80 | $(PIXELMAPDIR)/Object2D.o\ |
|---|
| 81 | $(PIXELMAPDIR)/Object3D.o\ |
|---|
| 82 | $(ATROUSDIR)/filter.o\ |
|---|
| 83 | $(ATROUSDIR)/atrous_1d_reconstruct.o\ |
|---|
| 84 | $(ATROUSDIR)/atrous_2d_reconstruct.o\ |
|---|
| 85 | $(ATROUSDIR)/atrous_3d_reconstruct.o\ |
|---|
| 86 | $(ATROUSDIR)/baselineSubtract.o\ |
|---|
| 87 | $(ATROUSDIR)/ReconSearch.o\ |
|---|
| 88 | $(DETECTIONDIR)/detection.o\ |
|---|
| 89 | $(DETECTIONDIR)/columns.o\ |
|---|
| 90 | $(DETECTIONDIR)/ObjectGrower.o\ |
|---|
| 91 | $(DETECTIONDIR)/areClose.o\ |
|---|
| 92 | $(DETECTIONDIR)/growObject.o\ |
|---|
| 93 | $(DETECTIONDIR)/lutz_detect.o\ |
|---|
| 94 | $(DETECTIONDIR)/mergeIntoList.o\ |
|---|
| 95 | $(DETECTIONDIR)/outputDetection.o\ |
|---|
| 96 | $(DETECTIONDIR)/sorting.o\ |
|---|
| 97 | $(DETECTIONDIR)/spectrumDetect.o\ |
|---|
| 98 | $(CUBESDIR)/cubes.o\ |
|---|
| 99 | $(CUBESDIR)/cubes_extended.o\ |
|---|
| 100 | $(CUBESDIR)/baseline.o\ |
|---|
| 101 | $(CUBESDIR)/CubicSearch.o\ |
|---|
| 102 | $(CUBESDIR)/detectionIO.o\ |
|---|
| 103 | $(CUBESDIR)/existingDetections.o\ |
|---|
| 104 | $(CUBESDIR)/getImage.o\ |
|---|
| 105 | $(CUBESDIR)/invertCube.o\ |
|---|
| 106 | $(CUBESDIR)/Merger.o\ |
|---|
| 107 | $(CUBESDIR)/momentMap.o\ |
|---|
| 108 | $(CUBESDIR)/readRecon.o\ |
|---|
| 109 | $(CUBESDIR)/readSmooth.o\ |
|---|
| 110 | $(CUBESDIR)/saveImage.o\ |
|---|
| 111 | $(CUBESDIR)/smoothCube.o\ |
|---|
| 112 | $(CUBESDIR)/spectraUtils.o\ |
|---|
| 113 | $(CUBESDIR)/trimImage.o\ |
|---|
| 114 | $(CUBESDIR)/VOTable.o\ |
|---|
| 115 | $(FITSIODIR)/dataIO.o\ |
|---|
| 116 | $(FITSIODIR)/headerIO.o\ |
|---|
| 117 | $(FITSIODIR)/subsection.o\ |
|---|
| 118 | $(FITSIODIR)/wcsIO.o\ |
|---|
| 119 | $(UTILDIR)/Section.o\ |
|---|
| 120 | $(UTILDIR)/Statistics.o\ |
|---|
| 121 | $(UTILDIR)/feedback.o\ |
|---|
| 122 | $(UTILDIR)/GaussSmooth1D.o\ |
|---|
| 123 | $(UTILDIR)/Hanning.o\ |
|---|
| 124 | $(UTILDIR)/getStats.o\ |
|---|
| 125 | $(UTILDIR)/linear_regression.o\ |
|---|
| 126 | $(UTILDIR)/position_related.o\ |
|---|
| 127 | $(UTILDIR)/sort.o\ |
|---|
| 128 | $(UTILDIR)/string_related.o\ |
|---|
| 129 | $(UTILDIR)/wcsFunctions.o\ |
|---|
| 130 | $(UTILDIR)/zscale.o |
|---|
| 131 | |
|---|
| 132 | ifeq ($(strip $(PGPLOTLIB)),) |
|---|
| 133 | OBJECTS = $(OBJECTS-NOPG) |
|---|
| 134 | else |
|---|
| 135 | OBJECTS = $(OBJECTS-NOPG)\ |
|---|
| 136 | $(CUBESDIR)/drawBlankEdges.o\ |
|---|
| 137 | $(CUBESDIR)/drawMomentCutout.o\ |
|---|
| 138 | $(CUBESDIR)/outputSpectra.o\ |
|---|
| 139 | $(CUBESDIR)/plotting.o\ |
|---|
| 140 | $(UTILDIR)/mycpgplot.o\ |
|---|
| 141 | $(CUBESDIR)/plots.o\ |
|---|
| 142 | $(UTILDIR)/pgplot_related.o |
|---|
| 143 | endif |
|---|
| 144 | |
|---|
| 145 | duchamp : $(OBJECTS) |
|---|
| 146 | $(LINK) -o $(EXEC) $(OBJECTS) $(LIBS) |
|---|
| 147 | |
|---|
| 148 | lib : $(OBJECTS) |
|---|
| 149 | $(AR) $(LIB) $(OBJECTS) |
|---|
| 150 | $(RANLIB) $(LIB) |
|---|
| 151 | |
|---|
| 152 | createTestImage : $(TESTDIR)/createTestImage.o $(UTILDIR)/get_random_spectrum.o |
|---|
| 153 | $(CXX) -o createTestImage.x\ |
|---|
| 154 | $(TESTDIR)/createTestImage.o $(UTILDIR)/get_random_spectrum.o\ |
|---|
| 155 | $(CFITSIOLIB) -lstdc++ -lm |
|---|
| 156 | |
|---|
| 157 | install : |
|---|
| 158 | $(INSTALL) -d -m 2755 $(INSTALLDIR) |
|---|
| 159 | $(INSTALL) -m 755 $(EXEC) $(INSTALLDIR) |
|---|
| 160 | $(RM) $(INSTALLDIR)/$(EXEC-STUB) |
|---|
| 161 | cd $(INSTALLDIR) && $(LN_S) $(EXEC) $(EXEC-STUB) |
|---|
| 162 | -test ! -f $(LIB) || $(INSTALL) -d -m 2755 $(LIBDIR) |
|---|
| 163 | -test ! -f $(LIB) || $(INSTALL) -m 644 $(LIB) $(LIBDIR) |
|---|
| 164 | $(INSTALL) -d -m 2755 $(INCDIR) |
|---|
| 165 | $(INSTALL) -m 644 $(BASE)/*.hh $(INCDIR) |
|---|
| 166 | $(INSTALL) -m 644 $(BASE)/*.h $(INCDIR) |
|---|
| 167 | $(INSTALL) -d -m 2755 $(INCDIR)/Cubes |
|---|
| 168 | $(INSTALL) -m 644 $(CUBESDIR)/*.hh $(INCDIR)/Cubes |
|---|
| 169 | $(INSTALL) -d -m 2755 $(INCDIR)/ATrous |
|---|
| 170 | $(INSTALL) -m 644 $(ATROUSDIR)/*.hh $(INCDIR)/ATrous |
|---|
| 171 | $(INSTALL) -d -m 2755 $(INCDIR)/Detection |
|---|
| 172 | $(INSTALL) -m 644 $(DETECTIONDIR)/*.hh $(INCDIR)/Detection |
|---|
| 173 | $(INSTALL) -d -m 2755 $(INCDIR)/PixelMap |
|---|
| 174 | $(INSTALL) -m 644 $(PIXELMAPDIR)/*.hh $(INCDIR)/PixelMap |
|---|
| 175 | $(INSTALL) -d -m 2755 $(INCDIR)/Utils |
|---|
| 176 | $(INSTALL) -m 644 $(UTILDIR)/*.hh $(INCDIR)/Utils |
|---|
| 177 | $(INSTALL) -m 644 $(UTILDIR)/*.tcc $(INCDIR)/Utils |
|---|
| 178 | |
|---|
| 179 | $(OBJECTS) : $(HEADS) |
|---|
| 180 | |
|---|
| 181 | .cc.o: |
|---|
| 182 | $(CXX) -c $< $(CINC) -o $@ |
|---|
| 183 | |
|---|
| 184 | .c.o: |
|---|
| 185 | $(CC) -c $< $(CINC) -o $@ |
|---|
| 186 | |
|---|
| 187 | clean : |
|---|
| 188 | rm -f $(BASE)/*.o $(ATROUSDIR)/*.o $(CUBESDIR)/*.o $(FITSIODIR)/*.o $(DETECTIONDIR)/*.o $(UTILDIR)/*.o $(PIXELMAPDIR)/*.o |
|---|
