Changeset 2237


Ignore:
Timestamp:
07/20/11 15:20:39 (13 years ago)
Author:
Takeshi Nakazato
Message:

New Development: No

JIRA Issue: No

Ready for Test: Yes

Interface Changes: No

What Interface Changed: Please list interface changes

Test Programs: List test programs

Put in Release Notes: Yes/No

Module(s): Module Names change impacts.

Description: Describe your changes here...

Refactoring MSFiller::fill() to detect bottle neck of the process.
There are no changes effectively.


Location:
trunk/src
Files:
2 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • trunk/src/MSFiller.cpp

    r2234 r2237  
    9595{
    9696  os_.origin( LogOrigin( "MSFiller", "open()", WHERE ) ) ;
    97 //   double startSec = gettimeofday_sec() ;
    98 //   os_ << "start MSFiller::open() startsec=" << startSec << LogIO::POST ;
     97  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     98  //os_ << "start MSFiller::open() startsec=" << startSec << LogIO::POST ;
    9999  //os_ << "   filename = " << filename << endl ;
    100100
    … …  
    147147  isData_ = mstable_.tableDesc().isColumn( "DATA" ) ;
    148148
    149 //   double endSec = gettimeofday_sec() ;
    150 //   os_ << "end MSFiller::open() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     149  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     150  //os_ << "end MSFiller::open() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
    151151  return true ;
    152152}
    … …  
    155155{
    156156  os_.origin( LogOrigin( "MSFiller", "fill()", WHERE ) ) ;
    157 //   double startSec = gettimeofday_sec() ;
    158 //   os_ << "start MSFiller::fill() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
    159 
    160 //   double time0 = gettimeofday_sec() ;
    161 //   os_ << "start init fill: " << time0 << LogIO::POST ;
     157  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     158  //os_ << "start MSFiller::fill() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     159
     160  //double time0 = gettimeofday_sec() ;
     161  //os_ << "start init fill: " << time0 << LogIO::POST ;
    162162
    163163  // Initialize header
    164164  STHeader sdh ; 
    165   sdh.nchan = 0 ;
    166   sdh.npol = 0 ;
    167   sdh.nif = 0 ;
    168   sdh.nbeam = 0 ;
    169   sdh.observer = "" ;
    170   sdh.project = "" ;
    171   sdh.obstype = "" ;
    172   sdh.antennaname = "" ;
    173   sdh.antennaposition.resize( 0 ) ;
    174   sdh.equinox = 0.0 ;
    175   sdh.freqref = "" ;
    176   sdh.reffreq = -1.0 ;
    177   sdh.bandwidth = 0.0 ;
    178   sdh.utc = 0.0 ;
    179   sdh.fluxunit = "" ;
    180   sdh.epoch = "" ;
    181   sdh.poltype = "" ;
     165  initHeader( sdh ) ;
    182166 
    183167  // check if optional table exists
    … …  
    269253  //fillHistory() ;
    270254
    271   // shared pointers
    272   ROTableColumn *tcolr ;
    273 
    274255  // MAIN
    275256  // Iterate over several ids
    … …  
    280261  MPosition mp( MVPosition( antpos ), MPosition::ITRF ) ;
    281262  if ( getPt_ ) {
    282     //pointtab = pointtab( pointtab.col("ANTENNA_ID")==antenna_ ).sort("TIME") ;
    283263    pointtab = MSPointing( pointtab( pointtab.col("ANTENNA_ID")==antenna_ ).sort("TIME") ) ;
    284264  }
    285   tcolr = tpoolr->construct( anttab, "STATION" ) ;
    286   String stationName = tcolr->asString( antenna_ ) ;
    287   tpoolr->destroy( tcolr ) ;
    288   tcolr = tpoolr->construct( anttab, "NAME" ) ;
    289   String antennaName = tcolr->asString( antenna_ ) ;
    290   tpoolr->destroy( tcolr ) ;
     265  String stationName = asString( "STATION", antenna_, anttab, tpoolr ) ;
     266  String antennaName = asString( "NAME", antenna_, anttab, tpoolr ) ;
    291267  sdh.antennaposition.resize( 3 ) ;
    292268  for ( int i = 0 ; i < 3 ; i++ )
    … …  
    294270  String telescopeName = "" ;
    295271
    296 //   double time1 = gettimeofday_sec() ;
    297 //   os_ << "end fill init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
     272  //double time1 = gettimeofday_sec() ;
     273  //os_ << "end fill init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
    298274
    299275  // row based
    … …  
    334310  TableIterator iter0( mstable_, "OBSERVATION_ID" ) ;
    335311  while( !iter0.pastEnd() ) {
    336 //     time0 = gettimeofday_sec() ;
    337 //     os_ << "start 0th iteration: " << time0 << LogIO::POST ;
     312    //time0 = gettimeofday_sec() ;
     313    //os_ << "start 0th iteration: " << time0 << LogIO::POST ;
    338314    Table t0 = iter0.table() ;
    339     tcolr = tpoolr->construct( t0, "OBSERVATION_ID" ) ;
    340     Int obsId = tcolr->asInt( 0 ) ;
    341     tpoolr->destroy( tcolr ) ;
     315    Int obsId = asInt( "OBSERVATION_ID", 0, t0, tpoolr ) ;
    342316    if ( sdh.observer == "" ) {
    343       tcolr = tpoolr->construct( obstab, "OBSERVER" ) ;
    344       sdh.observer = tcolr->asString( obsId ) ;
    345       tpoolr->destroy( tcolr ) ;
     317      sdh.observer = asString( "OBSERVER", obsId, obstab, tpoolr ) ;
    346318    }
    347319    if ( sdh.project == "" ) {
    348       tcolr = tpoolr->construct( obstab, "PROJECT" ) ;
    349       sdh.observer = tcolr->asString( obsId ) ;
    350       tpoolr->destroy( tcolr ) ;
     320      sdh.project = asString( "PROJECT", obsId, obstab, tpoolr ) ;
    351321    }
    352322    ROArrayMeasColumn<MEpoch> *tmpMeasCol = new ROArrayMeasColumn<MEpoch>( obstab, "TIME_RANGE" ) ;
    … …  
    357327    }
    358328    if ( telescopeName == "" ) {
    359       tcolr = tpoolr->construct( obstab, "TELESCOPE_NAME" ) ;
    360       telescopeName = tcolr->asString( obsId ) ;
    361       tpoolr->destroy( tcolr ) ;
     329      telescopeName = asString( "TELESCOPE_NAME", obsId, obstab, tpoolr ) ;
    362330    }
    363331    Int nbeam = 0 ;
    364 //     time1 = gettimeofday_sec() ;
    365 //     os_ << "end 0th iteration init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
     332    //time1 = gettimeofday_sec() ;
     333    //os_ << "end 0th iteration init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
    366334    //
    367335    // ITERATION: FEED1
    … …  
    369337    TableIterator iter1( t0, "FEED1" ) ;
    370338    while( !iter1.pastEnd() ) {
    371 //       time0 = gettimeofday_sec() ;
    372 //       os_ << "start 1st iteration: " << time0 << LogIO::POST ;
     339      //time0 = gettimeofday_sec() ;
     340      //os_ << "start 1st iteration: " << time0 << LogIO::POST ;
    373341      Table t1 = iter1.table() ;
    374342      // assume FEED1 == FEED2
    375       tcolr = tpoolr->construct( t1, "FEED1" ) ;
    376       Int feedId = tcolr->asInt( 0 ) ;
    377       tpoolr->destroy( tcolr ) ;
     343      Int feedId = asInt( "FEED1", 0, t1, tpoolr ) ;
    378344      nbeam++ ;
    379345
    … …  
    386352      *uintRF = 0 ;
    387353
    388 //       time1 = gettimeofday_sec() ;
    389 //       os_ << "end 1st iteration init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
     354      //time1 = gettimeofday_sec() ;
     355      //os_ << "end 1st iteration init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
    390356      //
    391357      // ITERATION: FIELD_ID
    … …  
    393359      TableIterator iter2( t1, "FIELD_ID" ) ;
    394360      while( !iter2.pastEnd() ) {
    395 //         time0 = gettimeofday_sec() ;
    396 //         os_ << "start 2nd iteration: " << time0 << LogIO::POST ;
     361        //time0 = gettimeofday_sec() ;
     362        //os_ << "start 2nd iteration: " << time0 << LogIO::POST ;
    397363        Table t2 = iter2.table() ;
    398         tcolr = tpoolr->construct( t2, "FIELD_ID" ) ;
    399         Int fieldId = tcolr->asInt( 0 ) ;
    400         tpoolr->destroy( tcolr ) ;
    401         tcolr = tpoolr->construct( fieldtab, "SOURCE_ID" ) ;
    402         Int srcId = tcolr->asInt( fieldId ) ;
    403         tpoolr->destroy( tcolr ) ;
    404         tcolr = tpoolr->construct( fieldtab, "NAME" ) ;
    405         String fieldName = tcolr->asString( fieldId ) + "__" + String::toString(fieldId) ;
    406         tpoolr->destroy( tcolr ) ;
     364        Int fieldId = asInt( "FIELD_ID", 0, t2, tpoolr ) ;
     365        Int srcId = asInt( "SOURCE_ID", fieldId, fieldtab, tpoolr ) ;
     366        String fieldName = asString( "NAME", fieldId, fieldtab, tpoolr ) ;
     367        fieldName += "__" + String::toString(fieldId) ;
    407368        ROArrayMeasColumn<MDirection> *delayDirCol = new ROArrayMeasColumn<MDirection>( fieldtab, "DELAY_DIR" ) ;
    408369        Vector<MDirection> delayDir = (*delayDirCol)( fieldId ) ;
    409         delete delayDirCol ;
    410         Vector<Double> defaultScanrate( 2, 0.0 ) ;
    411         Vector<Double> defaultDir = delayDir[0].getAngle( "rad" ).getValue() ;
    412         if ( delayDir.nelements() > 1 )
    413           defaultScanrate = delayDir[1].getAngle( "rad" ).getValue() ;
    414          
     370        delete delayDirCol ;         
    415371
    416372        // FIELDNAME
    … …  
    419375
    420376
    421 //         time1 = gettimeofday_sec() ;
    422 //         os_ << "end 2nd iteration init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
     377        //time1 = gettimeofday_sec() ;
     378        //os_ << "end 2nd iteration init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
    423379        //
    424380        // ITERATION: DATA_DESC_ID
    … …  
    426382        TableIterator iter3( t2, "DATA_DESC_ID" ) ;
    427383        while( !iter3.pastEnd() ) {
    428 //           time0 = gettimeofday_sec() ;
    429 //           os_ << "start 3rd iteration: " << time0 << LogIO::POST ;
     384          //time0 = gettimeofday_sec() ;
     385          //os_ << "start 3rd iteration: " << time0 << LogIO::POST ;
    430386          Table t3 = iter3.table() ;
    431           tcolr = tpoolr->construct( t3, "DATA_DESC_ID" ) ;
    432           Int ddId = tcolr->asInt( 0 ) ;
    433           tpoolr->destroy( tcolr ) ;
    434           tcolr = tpoolr->construct( ddtab, "POLARIZATION_ID" ) ;
    435           Int polId = tcolr->asInt( ddId ) ;
    436           tpoolr->destroy( tcolr ) ;
    437           tcolr = tpoolr->construct( ddtab, "SPECTRAL_WINDOW_ID" ) ;
    438           Int spwId = tcolr->asInt( ddId ) ;
    439           tpoolr->destroy( tcolr ) ;
     387          Int ddId = asInt( "DATA_DESC_ID", 0, t3, tpoolr ) ;
     388          Int polId = asInt( "POLARIZATION_ID", ddId, ddtab, tpoolr ) ;
     389          Int spwId = asInt( "SPECTRAL_WINDOW_ID", ddId, ddtab, tpoolr ) ;
    440390
    441391          // IFNO
    … …  
    444394
    445395          // polarization information
    446           tcolr = tpoolr->construct( poltab, "NUM_CORR" ) ;
    447           Int npol = tcolr->asInt( polId ) ;
    448           tpoolr->destroy( tcolr ) ;
     396          Int npol = asInt( "NUM_CORR", polId, poltab, tpoolr ) ;
    449397          ROArrayColumn<Int> *roArrICol = new ROArrayColumn<Int>( poltab, "CORR_TYPE" ) ;
    450398          Vector<Int> corrtype = (*roArrICol)( polId ) ;
    451399          delete roArrICol ;
    452 //           os_ << "npol = " << npol << LogIO::POST ;
    453 //           os_ << "corrtype = " << corrtype << LogIO::POST ;
    454           // source information
    455 //           os_ << "srcId = " << srcId << ", spwId = " << spwId << LogIO::POST ;
    456           MSSource srctabSel = srctab( srctab.col("SOURCE_ID") == srcId && srctab.col("SPECTRAL_WINDOW_ID") == spwId ) ;
    457           if ( srctabSel.nrow() == 0 ) {
    458             srctabSel = srctab( srctab.col("SOURCE_ID") == srcId && srctab.col("SPECTRAL_WINDOW_ID") == -1 ) ;
    459           }
    460400          String srcName( "" ) ;
    461401          Vector<Double> srcPM( 2, 0.0 ) ;
    462402          Vector<Double> srcDir( 2, 0.0 ) ;
    463403          MDirection md ;
    464           Int numLines = 0 ;
    465           ROArrayColumn<Double> *roArrDCol = 0 ;
    466           if ( srctabSel.nrow() > 0 ) {
    467             // source name
    468             tcolr = tpoolr->construct( srctabSel, "NAME" ) ;
    469             srcName = tcolr->asString( 0 ) ;
    470             tpoolr->destroy( tcolr ) ;
    471 
    472             // source proper motion
    473             roArrDCol = new ROArrayColumn<Double>( srctabSel, "PROPER_MOTION" ) ;
    474             srcPM = (*roArrDCol)( 0 ) ;
    475             delete roArrDCol ;
    476            
    477             // source direction
    478             roArrDCol = new ROArrayColumn<Double>( srctabSel, "DIRECTION" ) ;
    479             srcDir = (*roArrDCol)( 0 ) ;
    480             delete roArrDCol ;
    481 
    482             // source direction as MDirection object
    483             ROScalarMeasColumn<MDirection> *tmpMeasCol = new ROScalarMeasColumn<MDirection>( srctabSel, "DIRECTION" ) ;
    484             md = (*tmpMeasCol)( 0 ) ;
    485             delete tmpMeasCol ;
    486 
    487             // number of lines
    488             tcolr = tpoolr->construct( srctabSel, "NUM_LINES" ) ;
    489             numLines = tcolr->asInt( 0 ) ;
    490             tpoolr->destroy( tcolr ) ;
    491 
    492           }
    493           else {
    494             md = MDirection( Quantum<Double>(0.0,Unit("rad")), Quantum<Double>(0.0,Unit("rad")) ) ;
    495           }
     404          Vector<Double> restFreqs ;
     405          Vector<String> transitionName ;
     406          Vector<Double> sysVels ;
     407//           os_ << "npol = " << npol << LogIO::POST ;
     408//           os_ << "corrtype = " << corrtype << LogIO::POST ;
     409
     410          // source and molecular transition
     411          sourceInfo( srcId, spwId, srcName, md, srcPM, restFreqs, transitionName, sysVels, tpoolr ) ;
     412//           os_ << "srcId = " << srcId << ", spwId = " << spwId << LogIO::POST ;
    496413
    497414          // SRCNAME
    … …  
    509426          // SRCDIRECTION
    510427          darrRF.attachToRecord( trec, "SRCDIRECTION" ) ;
    511           *darrRF = srcDir ;
     428//           *darrRF = srcDir ;
     429          *darrRF = md.getAngle().getValue( "rad" ) ;
    512430
    513431          //os_ << "srcDir = " << srcDir << LogIO::POST ;
    514432
    515           // for MOLECULES subtable
    516 //           os_ << "numLines = " << numLines << LogIO::POST ;
    517 
    518           Vector<Double> restFreqs( numLines, 0.0 ) ;
    519           Vector<String> transitionName( numLines, "" ) ;
    520           Vector<Double> sysVels ;
     433          // SRCVELOCITY
    521434          Double sysVel = 0.0 ;
    522           if ( numLines != 0 ) {
    523             if ( srctabSel.tableDesc().isColumn( "REST_FREQUENCY" ) ) {
    524               sharedQDArrCol = new ROArrayQuantColumn<Double>( srctabSel, "REST_FREQUENCY" ) ;
    525               Array< Quantum<Double> > qRestFreqs = (*sharedQDArrCol)( 0 ) ;
    526               delete sharedQDArrCol ;
    527               for ( int i = 0 ; i < numLines ; i++ ) {
    528                 restFreqs[i] = qRestFreqs( IPosition( 1, i ) ).getValue( "Hz" ) ;
    529               }
    530             }
    531 //             os_ << "restFreqs = " << restFreqs << LogIO::POST ;
    532             if ( srctabSel.tableDesc().isColumn( "TRANSITION" ) ) {
    533               ROArrayColumn<String> transitionCol( srctabSel, "TRANSITION" ) ;
    534               if ( transitionCol.isDefined( 0 ) )
    535                 transitionName = transitionCol( 0 ) ;
    536               //os_ << "transitionNameCol.nrow() = " << transitionCol.nrow() << LogIO::POST ;
    537             }
    538             if ( srctabSel.tableDesc().isColumn( "SYSVEL" ) ) {
    539               roArrDCol = new ROArrayColumn<Double>( srctabSel, "SYSVEL" ) ;
    540               sysVels = (*roArrDCol)( 0 ) ;
    541               delete roArrDCol ;
    542             }
    543             if ( !sysVels.empty() ) {
    544               //os_ << "sysVels.shape() = " << sysVels.shape() << LogIO::POST ;
    545               // NB: assume all SYSVEL values are the same
    546               sysVel = sysVels( IPosition(1,0) ) ;
    547             }
    548           }
    549 
    550           // SRCVELOCITY
     435          if ( !sysVels.empty() )
     436            sysVel = sysVels[0] ;
    551437          RecordFieldPtr<Double> doubleRF( trec, "SRCVELOCITY" ) ;
    552438          *doubleRF = sysVel ;
    … …  
    562448          // spectral setup
    563449          uInt freqId ;
    564           tcolr = tpoolr->construct( spwtab, "NUM_CHAN" ) ;
    565           Int nchan = tcolr->asInt( spwId ) ;
     450          Int nchan = asInt( "NUM_CHAN", spwId, spwtab, tpoolr ) ;
    566451          Bool iswvr = False ;
    567452          if ( nchan == 4 ) iswvr = True ;
    568           tpoolr->destroy( tcolr ) ;
     453          sdh.nchan = max( sdh.nchan, nchan ) ;
    569454          map<Int,uInt>::iterator iter = ifmap.find( spwId ) ;
    570455          if ( iter == ifmap.end() ) {
    571             ROScalarQuantColumn<Double> *tmpQuantCol = new ROScalarQuantColumn<Double>( t3, "TIME" ) ;
    572             me = MEpoch( (*tmpQuantCol)( 0 ), MEpoch::UTC ) ;
    573             delete tmpQuantCol ;
    574             MeasFrame mf( me, mp, md ) ;
    575             tcolr = tpoolr->construct( spwtab, "MEAS_FREQ_REF" ) ;
    576             MFrequency::Types freqRef = MFrequency::castType((uInt)(tcolr->asInt(spwId))) ;
    577             tpoolr->destroy( tcolr ) ;
    578             Bool even = False ;
    579             if ( (nchan/2)*2 == nchan ) even = True ;
    580             sdh.nchan = max( sdh.nchan, nchan ) ;
    581             tmpQuantCol = new ROScalarQuantColumn<Double>( spwtab, "TOTAL_BANDWIDTH" ) ;
    582             Double totbw = (*tmpQuantCol)( spwId ).getValue( "Hz" ) ;
    583             delete tmpQuantCol ;
    584             if ( nchan != 4 )
    585               sdh.bandwidth = max( sdh.bandwidth, totbw ) ;
    586             if ( sdh.freqref == "" && nchan != 4)
    587               //sdh.freqref = MFrequency::showType( freqRef ) ;
    588               sdh.freqref = "LSRK" ;
    589             if ( sdh.reffreq == -1.0 && nchan != 4 ) {
    590               tmpQuantCol = new ROScalarQuantColumn<Double>( spwtab, "REF_FREQUENCY" ) ;
    591               Quantum<Double> qreffreq = (*tmpQuantCol)( spwId ) ;
    592               delete tmpQuantCol ;
    593               //             sdh.reffreq = qreffreq.getValue("Hz") ;
    594               if ( freqRef == MFrequency::LSRK ) {
    595                 sdh.reffreq = qreffreq.getValue("Hz") ;
    596               }
    597               else {
    598                 MFrequency::Convert tolsr( freqRef, MFrequency::Ref( MFrequency::LSRK, mf ) ) ;
    599                 sdh.reffreq = tolsr( qreffreq ).get("Hz").getValue() ;
    600               }
    601             }
    602             Int refchan = nchan / 2 ;
    603             IPosition refip( 1, refchan ) ;
    604             Double refpix = 0.5*(nchan-1) ;
    605             Double refval = 0.0 ;
    606             sharedQDArrCol = new ROArrayQuantColumn<Double>( spwtab, "CHAN_WIDTH" ) ;
    607             Double increment = (*sharedQDArrCol)( spwId )( refip ).getValue( "Hz" ) ;
    608             delete sharedQDArrCol ;
    609             //           os_ << "nchan = " << nchan << " refchan = " << refchan << "(even=" << even << ") refpix = " << refpix << LogIO::POST ;
    610             sharedQDArrCol = new ROArrayQuantColumn<Double>( spwtab, "CHAN_FREQ" ) ;
    611             Vector< Quantum<Double> > chanFreqs = (*sharedQDArrCol)( spwId ) ;
    612             delete sharedQDArrCol ;
    613             if ( nchan > 1 && chanFreqs[0].getValue("Hz") > chanFreqs[1].getValue("Hz") )
    614               increment *= -1.0 ;
    615             //           if ( even ) {
    616             //             IPosition refip0( 1, refchan-1 ) ;
    617             //             Double refval0 = chanFreqs(refip0).getValue("Hz") ;
    618             //             Double refval1 = chanFreqs(refip).getValue("Hz") ;
    619             //             refval = 0.5 * ( refval0 + refval1 ) ;
    620             //           }
    621             //           else {
    622             //             refval = chanFreqs(refip).getValue("Hz") ;
    623             //           }
    624             if ( freqRef == MFrequency::LSRK ) {
    625               if ( even ) {
    626                 IPosition refip0( 1, refchan-1 ) ;
    627                 Double refval0 = chanFreqs(refip0).getValue("Hz") ;
    628                 Double refval1 = chanFreqs(refip).getValue("Hz") ;
    629                 refval = 0.5 * ( refval0 + refval1 ) ;
    630               }
    631               else {
    632                 refval = chanFreqs(refip).getValue("Hz") ;
    633               }
    634             }
    635             else {
    636               MFrequency::Convert tolsr( freqRef, MFrequency::Ref( MFrequency::LSRK, mf ) ) ;
    637               if ( even ) {
    638                 IPosition refip0( 1, refchan-1 ) ;
    639                 Double refval0 = chanFreqs(refip0).getValue("Hz") ;
    640                 Double refval1 = chanFreqs(refip).getValue("Hz") ;
    641                 refval = 0.5 * ( refval0 + refval1 ) ;
    642                 refval = tolsr( refval ).get("Hz").getValue() ;
    643               }
    644               else {
    645                 refval = tolsr( chanFreqs(refip) ).get("Hz").getValue() ;
    646               }
    647             }
     456            ROScalarMeasColumn<MEpoch> *tmpMeasCol = new ROScalarMeasColumn<MEpoch>( t3, "TIME" ) ;
     457            me = (*tmpMeasCol)( 0 ) ;
     458            delete tmpMeasCol ;
     459            Double refpix ;
     460            Double refval ;
     461            Double increment ;
     462            spectralSetup( spwId,
     463                           me,
     464                           mp,
     465                           md,
     466                           refpix,
     467                           refval,
     468                           increment,
     469                           nchan,
     470                           sdh.freqref,
     471                           sdh.reffreq,
     472                           sdh.bandwidth,
     473                           tpoolr ) ;
    648474            freqId = table_->frequencies().addEntry( refpix, refval, increment ) ;
    649             //if ( ifmap.find( spwId ) == ifmap.end() ) {
    650475            ifmap.insert( pair<Int, uInt>(spwId,freqId) ) ;
    651476            //os_ << "added to ifmap: (" << spwId << "," << freqId << ")" << LogIO::POST ;
    … …  
    680505          if ( !iswvr && sdh.poltype == "" ) sdh.poltype = getPolType( corrtype[0] ) ;
    681506
    682 //           time1 = gettimeofday_sec() ;
    683 //           os_ << "end 3rd iteration init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
     507          //time1 = gettimeofday_sec() ;
     508          //os_ << "end 3rd iteration init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
    684509          //
    685510          // ITERATION: SCAN_NUMBER
    … …  
    687512          TableIterator iter4( t3, "SCAN_NUMBER" ) ;
    688513          while( !iter4.pastEnd() ) {
    689 //             time0 = gettimeofday_sec() ;
    690 //             os_ << "start 4th iteration: " << time0 << LogIO::POST ;
     514            //time0 = gettimeofday_sec() ;
     515            //os_ << "start 4th iteration: " << time0 << LogIO::POST ;
    691516            Table t4 = iter4.table() ;
    692             tcolr = tpoolr->construct( t4, "SCAN_NUMBER" ) ;
    693             Int scanNum = tcolr->asInt( 0 ) ;
    694             tpoolr->destroy( tcolr ) ;
     517            Int scanNum = asInt( "SCAN_NUMBER", 0, t4, tpoolr ) ;
    695518
    696519            // SCANNO
    … …  
    698521            *uintRF = scanNum - 1 ;
    699522
    700 //             time1 = gettimeofday_sec() ;
    701 //             os_ << "end 4th iteration init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
     523            //time1 = gettimeofday_sec() ;
     524            //os_ << "end 4th iteration init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
    702525            //
    703526            // ITERATION: STATE_ID
    … …  
    705528            TableIterator iter5( t4, "STATE_ID" ) ;
    706529            while( !iter5.pastEnd() ) {
    707 //               time0 = gettimeofday_sec() ;
    708 //               os_ << "start 5th iteration: " << time0 << LogIO::POST ;
     530              //time0 = gettimeofday_sec() ;
     531              //os_ << "start 5th iteration: " << time0 << LogIO::POST ;
    709532              Table t5 = iter5.table() ;
    710               tcolr = tpoolr->construct( t5, "STATE_ID" ) ;
    711               Int stateId = tcolr->asInt( 0 ) ;
    712               tpoolr->destroy( tcolr ) ;
    713               tcolr = tpoolr->construct( stattab, "OBS_MODE" ) ;
    714               String obstype = tcolr->asString( stateId ) ;
    715               tpoolr->destroy( tcolr ) ;
     533              Int stateId = asInt( "STATE_ID", 0, t5, tpoolr ) ;
     534              String obstype = asString( "OBS_MODE", 0, stattab, tpoolr ) ;
    716535              if ( sdh.obstype == "" ) sdh.obstype = obstype ;
    717536
    718537              Int nrow = t5.nrow() ;
    719 //               time1 = gettimeofday_sec() ;
    720 //               os_ << "end 5th iteration init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
     538              //time1 = gettimeofday_sec() ;
     539              //os_ << "end 5th iteration init: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
    721540
    722541              uInt cycle = 0 ;
    … …  
    724543              Cube<Float> spArr ;
    725544              Cube<Bool> flArr ;
    726               if ( isFloatData_ ) {
    727                 ROArrayColumn<Bool> mFlagCol( t5, "FLAG" ) ;
    728                 ROArrayColumn<Float> mFloatDataCol( t5, "FLOAT_DATA" ) ;
    729                 spArr = mFloatDataCol.getColumn() ;
    730                 flArr = mFlagCol.getColumn() ;
    731                 if ( sdh.fluxunit == "" ) {
    732                   const TableRecord &dataColKeys = mFloatDataCol.keywordSet() ;
    733                   if ( dataColKeys.isDefined( "UNIT" ) )
    734                     sdh.fluxunit = dataColKeys.asString( "UNIT" ) ;
    735                   else if ( dataColKeys.isDefined( "QuantumUnits" ) )
    736                     sdh.fluxunit = dataColKeys.asString( "QuantumUnits" ) ;
    737                 }
     545              reshapeSpectraAndFlagtra( spArr,
     546                                        flArr,
     547                                        t5,
     548                                        npol,
     549                                        nchan,
     550                                        nrow,
     551                                        corrtype ) ;
     552              if ( sdh.fluxunit == "" ) {
     553                String colName = "FLOAT_DATA" ;
     554                if ( isData_ ) colName = "DATA" ;
     555                ROTableColumn dataCol( t5, colName ) ;
     556                const TableRecord &dataColKeys = dataCol.keywordSet() ;
     557                if ( dataColKeys.isDefined( "UNIT" ) )
     558                  sdh.fluxunit = dataColKeys.asString( "UNIT" ) ;
     559                else if ( dataColKeys.isDefined( "QuantumUnits" ) )
     560                  sdh.fluxunit = dataColKeys.asString( "QuantumUnits" ) ;
    738561              }
    739               else if ( isData_ ) {
    740                 spArr.resize( npol, nchan, nrow ) ;
    741                 flArr.resize( npol, nchan, nrow ) ;
    742                 ROArrayColumn<Bool> mFlagCol( t5, "FLAG" ) ;
    743                 ROArrayColumn<Complex> mDataCol( t5, "DATA" ) ;
    744                 for ( Int irow = 0 ; irow < nrow ; irow++ ) {
    745                   Bool crossOK = False ;
    746                   Matrix<Complex> sp = mDataCol( irow ) ;
    747                   Matrix<Bool> fl = mFlagCol( irow ) ;
    748                   Matrix<Float> spxy = spArr.xyPlane( irow ) ;
    749                   Matrix<Bool> flxy = flArr.xyPlane( irow ) ;
    750                   for ( Int ipol = 0 ; ipol < npol ; ipol++ ) {
    751                     if ( corrtype[ipol] == Stokes::XY || corrtype[ipol] == Stokes::YX
    752                          || corrtype[ipol] == Stokes::RL || corrtype[ipol] == Stokes::LR ) {
    753                       if ( !crossOK ) {
    754                         spxy.row( ipol ) = real( sp.row( ipol ) ) ;
    755                         flxy.row( ipol ) = fl.row( ipol ) ;
    756                         if ( corrtype[ipol] == Stokes::XY || corrtype[ipol] == Stokes::RL ) {
    757                           spxy.row( ipol+1 ) = imag( sp.row( ipol ) ) ;
    758                           flxy.row( ipol+1 ) = fl.row( ipol ) ;
    759                         }                       
    760                         else {
    761                           spxy.row( ipol+1 ) = imag( conj( sp.row( ipol ) ) ) ;
    762                           flxy.row( ipol+1 ) = fl.row( ipol ) ;
    763                         }
    764                         crossOK = True ;
    765                       }
    766                     }
    767                     else {
    768                       spxy.row( ipol ) = real( sp.row( ipol ) ) ;
    769                       flxy.row( ipol ) = fl.row( ipol ) ;
    770                     }
    771                   }
    772                 }
    773                 if ( sdh.fluxunit == "" ) {
    774                   const TableRecord &dataColKeys = mDataCol.keywordSet() ;
    775                   if ( dataColKeys.isDefined( "UNIT" ) )
    776                     sdh.fluxunit = dataColKeys.asString( "UNIT" ) ;
    777                   else if ( dataColKeys.isDefined( "QuantumUnits" ) )
    778                     sdh.fluxunit = dataColKeys.asString( "QuantumUnits" ) ;
    779                 }
    780               }
     562
    781563              ROScalarMeasColumn<MEpoch> *mTimeCol = new ROScalarMeasColumn<MEpoch>( t5, "TIME" ) ;
    782564              Block<MEpoch> mTimeB( nrow ) ;
    783565              for ( Int irow = 0 ; irow < nrow ; irow++ )
    784566                mTimeB[irow] = (*mTimeCol)( irow ) ;
    785               ROTableColumn *mIntervalCol = tpoolr->construct( t5, "INTERVAL" ) ;
    786               ROTableColumn *mFlagRowCol = tpoolr->construct( t5, "FLAG_ROW" ) ;
     567//               ROTableColumn *mIntervalCol = tpoolr->construct( t5, "INTERVAL" ) ;
     568//               ROTableColumn *mFlagRowCol = tpoolr->construct( t5, "FLAG_ROW" ) ;
    787569              Block<Int> sysCalIdx( nrow, -1 ) ;
    788570              if ( isSysCal_ ) {
    … …  
    793575              Int srcType = getSrcType( stateId, tpoolr ) ;
    794576              uInt diridx = 0 ;
    795               MDirection::Types dirType ;
    796577              uInt wid = 0 ;
    797578              Int pidx = 0 ;
    … …  
    825606
    826607                // FLAGROW
    827                 *flrRF = (uInt)mFlagRowCol->asBool( irow ) ;
     608//                 *flrRF = (uInt)mFlagRowCol->asBool( irow ) ;
     609                *flrRF = (uInt)asBool( "FLAG_ROW", irow, t5, tpoolr ) ;
    828610
    829611                // SPECTRA, FLAG
    … …  
    837619
    838620                // INTERVAL
    839                 *intervalRF = (Double)(mIntervalCol->asdouble( irow )) ;
     621//                 *intervalRF = (Double)(mIntervalCol->asdouble( irow )) ;
     622                *intervalRF = asDouble( "INTERVAL", irow, t5, tpoolr ) ;
    840623
    841624                // TSYS
    … …  
    863646
    864647                // DIRECTION, AZEL, SCANRATE
    865                 if ( getPt_ ) {
    866                   Vector<Double> dir ;
    867                   Vector<Double> scanrate ;
    868                   String refString ;
    869                   diridx = getDirection( diridx, dir, scanrate, refString, pointtab, mTimeB[irow].get("s").getValue() ) ;
    870                   MDirection::getType( dirType, refString ) ;
    871                   MeasFrame mf( mTimeB[irow], mp ) ;
    872                   //mf.resetEpoch( mTimeB[irow] ) ;
    873                   //mf.resetDirection( MDirection( MVDirection(dir), dirType ) ) ;
    874                   if ( refString == "J2000" ) {
    875                     *dirRF = dir ;
    876                     MDirection::Convert toazel( dirType, MDirection::Ref( MDirection::AZEL, mf ) ) ;
    877                     Vector<Double> azel = toazel( dir ).getAngle("rad").getValue() ;
    878                     *azRF = (Float)azel(0) ;
    879                     *elRF = (Float)azel(1) ;
    880                   }
    881                   else if ( refString(0,4) == "AZEL" ) {
    882                     *azRF = (Float)dir(0) ;
    883                     *elRF = (Float)dir(1) ;
    884                     MDirection::Convert toj2000( dirType, MDirection::Ref( MDirection::J2000, mf ) ) ;
    885                     Vector<Double> newdir = toj2000( dir ).getAngle("rad").getValue() ;
    886                     *dirRF = newdir ;
    887                   }
    888                   else {
    889                     MDirection::Convert toazel( dirType, MDirection::Ref( MDirection::AZEL, mf ) ) ;
    890                     Vector<Double> azel = toazel( dir ).getAngle("rad").getValue() ;
    891                     MDirection::Convert toj2000( dirType, MDirection::Ref( MDirection::J2000, mf ) ) ;
    892                     Vector<Double> newdir = toj2000( dir ).getAngle("rad").getValue() ;
    893                     *dirRF = newdir ;
    894                     *azRF = (Float)azel(0) ;
    895                     *elRF = (Float)azel(1) ;
    896                   }
    897                   if ( scanrate.size() != 0 ) {
    898                     *scrRF = scanrate ;
    899                   }
    900                   else {
    901                     *scrRF = defaultScanrate ;
    902                   }
    903                 }
    904                 else {
    905                   String ref = md.getRefString() ;
    906                   //Vector<Double> defaultDir = srcDir ;
    907                   MDirection::getType( dirType, "J2000" ) ;
    908                   MeasFrame mf( mTimeB[irow], mp ) ;
    909                   if ( ref != "J2000" ) {
    910                     ROScalarMeasColumn<MEpoch> tmCol( pointtab, "TIME" ) ;
    911                     mf.resetEpoch( tmCol( 0 ) ) ;
    912                     MDirection::Convert toj2000( dirType, MDirection::Ref( MDirection::J2000, mf ) ) ;
    913                     defaultDir = toj2000( defaultDir ).getAngle("rad").getValue() ;
    914                   }
    915                   mf.resetEpoch( mTimeB[irow] ) ;
    916                   MDirection::Convert toazel( dirType, MDirection::Ref( MDirection::AZEL, mf ) ) ;
    917                   Vector<Double> azel = toazel( defaultDir ).getAngle("rad").getValue() ;
    918                   *azRF = (Float)azel(0) ;
    919                   *elRF = (Float)azel(1) ;
    920                   *dirRF = defaultDir ;
    921                   *scrRF = defaultScanrate ;
    922                 }
     648                Vector<Double> dir ;
     649                Vector<Double> azel ;
     650                Vector<Double> scanrate ;
     651                String refString ;
     652                if ( getPt_ )
     653                  diridx = getDirection( diridx, dir, azel, scanrate, pointtab, mTimeB[irow], mp ) ;
     654                else
     655                  getSourceDirection( dir, azel, scanrate, mTimeB[irow], mp, delayDir ) ;
     656                *dirRF = dir ;
     657                *azRF = azel[0] ;
     658                *elRF = azel[1] ;
     659                *scrRF = scanrate ;
    923660
    924661                // Polarization dependent things
    … …  
    927664                  *polnoRF = polnos[ipol] ;
    928665
    929                   //*spRF = sp.row( ipol ) ;
    930                   //*ucarrRF = fl.row( ipol ) ;
    931                   //*tsysRF = tsys.row( ipol ) ;
    932666                  spRF.define( sp.row( ipol ) ) ;
    933667                  ucarrRF.define( fl.row( ipol ) ) ;
    … …  
    942676                cycle++ ;
    943677              }
    944               tpoolr->destroy( mIntervalCol ) ;
    945               tpoolr->destroy( mFlagRowCol ) ;
    946 
    947 //               time1 = gettimeofday_sec() ;
    948 //               os_ << "end 5th iteration: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
     678
     679              //time1 = gettimeofday_sec() ;
     680              //os_ << "end 5th iteration: " << time1 << " (" << time1-time0 << "sec)" << LogIO::POST ;
    949681
    950682              iter5.next() ;
    951683            }
    952 
    953 
    954684            iter4.next() ;
    955685          }
    956 
    957 
    958686          iter3.next() ;
    959687        }
    960 
    961              
    962688        iter2.next() ;
    963689      }
    964 
    965 
    966690      iter1.next() ;
    967691    }
    … …  
    1008732    sdh.freqref = "SOURCE";
    1009733  }
    1010   //if ( sdh.fluxunit == "" )
     734
    1011735  if ( sdh.fluxunit == "" || sdh.fluxunit == "CNTS" )
    1012736    sdh.fluxunit = "K" ;
    … …  
    1043767  }
    1044768
    1045 //   double endSec = gettimeofday_sec() ;
    1046 //   os_ << "end MSFiller::fill() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     769  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     770  //os_ << "end MSFiller::fill() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
    1047771}
    1048772
    … …  
    1057781Int MSFiller::getSrcType( Int stateId, boost::object_pool<ROTableColumn> *tpool )
    1058782{
    1059 //   double startSec = gettimeofday_sec() ;
    1060 //   os_ << "start MSFiller::getSrcType() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     783  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     784  //os_ << "start MSFiller::getSrcType() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
    1061785
    1062786  MSState statetab = mstable_.state() ;
    1063   ROTableColumn *sharedCol ;
    1064   sharedCol = tpool->construct( statetab, "OBS_MODE" ) ;
    1065   String obsMode = sharedCol->asString( stateId ) ;
    1066   tpool->destroy( sharedCol ) ;
    1067   sharedCol = tpool->construct( statetab, "SIG" ) ;
    1068   Bool sig = sharedCol->asBool( stateId ) ;
    1069   tpool->destroy( sharedCol ) ;
    1070   sharedCol = tpool->construct( statetab, "REF" ) ;
    1071   Bool ref = sharedCol->asBool( stateId ) ;
    1072   tpool->destroy( sharedCol ) ;
    1073   sharedCol = tpool->construct( statetab, "CAL" ) ;
    1074   Double cal = (Double)(sharedCol->asdouble( stateId )) ;
    1075   tpool->destroy( sharedCol ) ;
     787  String obsMode = asString( "OBS_MODE", stateId, statetab, tpool ) ;
     788  Bool sig = asBool( "SIG", stateId, statetab, tpool ) ;
     789  Bool ref = asBool( "REF", stateId, statetab, tpool ) ;
     790  Double cal = asDouble( "CAL", stateId, statetab, tpool ) ;
    1076791  //os_ << "OBS_MODE = " << obsMode << LogIO::POST ;
    1077792
    … …  
    1222937   
    1223938  //os_ << "srcType = " << srcType << LogIO::POST ;
    1224 //   double endSec = gettimeofday_sec() ;
    1225 //   os_ << "end MSFiller::getSrcType() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     939  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     940  //os_ << "end MSFiller::getSrcType() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
    1226941  return srcType ;
    1227942}
    … …  
    1230945Block<uInt> MSFiller::getPolNo( Int corrType )
    1231946{
    1232 //   double startSec = gettimeofday_sec() ;
    1233 //   os_ << "start MSFiller::getPolNo() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     947  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     948  //os_ << "start MSFiller::getPolNo() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
    1234949  Block<uInt> polno( 1 ) ;
    1235950
    … …  
    1261976  }
    1262977  //os_ << "polno = " << polno << LogIO::POST ;
    1263 //   double endSec = gettimeofday_sec() ;
    1264 //   os_ << "end MSFiller::getPolNo() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     978  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     979  //os_ << "end MSFiller::getPolNo() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
    1265980 
    1266981  return polno ;
    … …  
    1269984String MSFiller::getPolType( Int corrType )
    1270985{
    1271 //   double startSec = gettimeofday_sec() ;
    1272 //   os_ << "start MSFiller::getPolType() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     986  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     987  //os_ << "start MSFiller::getPolType() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
    1273988  String poltype = "" ;
    1274989
    … …  
    1282997    poltype = "linpol" ;
    1283998
    1284 //   double endSec = gettimeofday_sec() ;
    1285 //   os_ << "end MSFiller::getPolType() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     999  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     1000  //os_ << "end MSFiller::getPolType() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
    12861001  return poltype ;
    12871002}
    … …  
    12891004void MSFiller::fillWeather()
    12901005{
    1291 //   double startSec = gettimeofday_sec() ;
    1292 //   os_ << "start MSFiller::fillWeather() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     1006  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     1007  //os_ << "start MSFiller::fillWeather() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
    12931008
    12941009  if ( !isWeather_ ) {
    … …  
    14301145  }
    14311146  //os_ << "mwTime[0] = " << mwTime_[0] << " mwInterval[0] = " << mwInterval_[0] << LogIO::POST ;
    1432 //   double endSec = gettimeofday_sec() ;
    1433 //   os_ << "end MSFiller::fillWeather() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     1147  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     1148  //os_ << "end MSFiller::fillWeather() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
    14341149}
    14351150
    14361151void MSFiller::fillFocus()
    14371152{
    1438 //   double startSec = gettimeofday_sec() ;
    1439 //   os_ << "start MSFiller::fillFocus() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     1153  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     1154  //os_ << "start MSFiller::fillFocus() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
    14401155  // tentative
    14411156  table_->focus().addEntry( 0.0, 0.0, 0.0, 0.0 ) ;
    1442 //   double endSec = gettimeofday_sec() ;
    1443 //   os_ << "end MSFiller::fillFocus() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     1157  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     1158  //os_ << "end MSFiller::fillFocus() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
    14441159}
    14451160
    14461161void MSFiller::fillTcal( boost::object_pool<ROTableColumn> *tpoolr )
    14471162{
    1448 //   double startSec = gettimeofday_sec() ;
    1449 //   os_ << "start MSFiller::fillTcal() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     1163  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     1164  //os_ << "start MSFiller::fillTcal() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
    14501165
    14511166  if ( !isSysCal_ ) {
    … …  
    15021217  Table tab = table_->tcal().table() ;
    15031218  ArrayColumn<Float> tcalCol( tab, "TCAL" ) ;
    1504   ROTableColumn *sharedCol ;
    15051219  uInt oldnr = 0 ;
    15061220  uInt newnr = 0 ;
    … …  
    15131227  while( !iter0.pastEnd() ) {
    15141228    Table t0 = iter0.table() ;
    1515     sharedCol = tpoolr->construct( t0, "FEED_ID" ) ;
    1516     Int feedId = sharedCol->asInt( 0 ) ;
    1517     tpoolr->destroy( sharedCol ) ;
     1229    Int feedId = asInt( "FEED_ID", 0, t0, tpoolr ) ;
    15181230    TableIterator iter1( t0, "SPECTRAL_WINDOW_ID" ) ;
    15191231    while( !iter1.pastEnd() ) {
    15201232      Table t1 = iter1.table() ;
    1521       sharedCol = tpoolr->construct( t1, "SPECTRAL_WINDOW_ID" ) ;
    1522       Int spwId = sharedCol->asInt( 0 ) ;
    1523       tpoolr->destroy( sharedCol ) ;
     1233      Int spwId = asInt( "SPECTRAL_WINDOW_ID", 0, t1, tpoolr ) ;
    15241234      tmpTcalCol = new ROArrayColumn<Float>( t1, colTcal_ ) ;
    15251235      ROScalarQuantColumn<Double> scTimeCol( t1, "TIME" ) ;
    … …  
    15551265
    15561266  //tcalrec_.print( std::cout ) ;
    1557 //   double endSec = gettimeofday_sec() ;
    1558 //   os_ << "end MSFiller::fillTcal() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     1267  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     1268  //os_ << "end MSFiller::fillTcal() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
    15591269}
    15601270
    15611271uInt MSFiller::getWeatherId( uInt idx, Double wtime )
    15621272{
    1563 //   double startSec = gettimeofday_sec() ;
    1564 //   os_ << "start MSFiller::getWeatherId() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     1273  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     1274  //os_ << "start MSFiller::getWeatherId() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
    15651275  uInt nrow = mwTime_.size() ;
    15661276  if ( nrow < 2 )
    … …  
    15991309  //os_ << LogIO::WARN << "Couldn't find correct WEATHER_ID for time " << wtime << LogIO::POST ;
    16001310
    1601 //   double endSec = gettimeofday_sec() ;
    1602 //   os_ << "end MSFiller::getWeatherId() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     1311  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     1312  //os_ << "end MSFiller::getWeatherId() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
    16031313  return wid ;
    16041314}
    … …  
    16061316void MSFiller::getSysCalTime( Vector<MEpoch> &scTime, Vector<Double> &scInterval, Block<MEpoch> &tcol, Block<Int> &tidx )
    16071317{
    1608 //   double startSec = gettimeofday_sec() ;
    1609 //   os_ << "start MSFiller::getSysCalTime() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     1318  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     1319  //os_ << "start MSFiller::getSysCalTime() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
    16101320
    16111321  if ( !isSysCal_ )
    … …  
    16531363    }
    16541364  }
    1655 //   double endSec = gettimeofday_sec() ;
    1656 //   os_ << "end MSFiller::getSysCalTime() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec) scnrow = " << scnrow << " tcol.nelements = " << tcol.nelements() << LogIO::POST ;
     1365  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     1366  //os_ << "end MSFiller::getSysCalTime() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec) scnrow = " << scnrow << " tcol.nelements = " << tcol.nelements() << LogIO::POST ;
    16571367  return ;
    16581368}
    … …  
    16601370Block<uInt> MSFiller::getTcalId( Int fid, Int spwid, MEpoch &t )
    16611371{
    1662 //   double startSec = gettimeofday_sec() ;
    1663 //   os_ << "start MSFiller::getTcalId() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     1372  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     1373  //os_ << "start MSFiller::getTcalId() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
    16641374  //if ( table_->tcal().table().nrow() == 0 ) {
    16651375  if ( !isSysCal_ ) {
    … …  
    16841394    tcalids[ipol] = ids[0] + ipol - 1 ;
    16851395
    1686 //   double endSec = gettimeofday_sec() ;
    1687 //   os_ << "end MSFiller::getTcalId() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     1396  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     1397  //os_ << "end MSFiller::getTcalId() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
    16881398  return tcalids ;
    16891399}
    … …  
    16911401uInt MSFiller::getDirection( uInt idx, Vector<Double> &dir, Vector<Double> &srate, String &ref, MSPointing &tab, Double t )
    16921402{
    1693 //   double startSec = gettimeofday_sec() ;
    1694 //   os_ << "start MSFiller::getDirection() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     1403  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     1404  //os_ << "start MSFiller::getDirection1() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
    16951405  // assume that cols is sorted by TIME
    16961406  Bool doInterp = False ;
    … …  
    17981508  }
    17991509
    1800 //   double endSec = gettimeofday_sec() ;
    1801 //   os_ << "end MSFiller::getDirection() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     1510  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     1511  //os_ << "end MSFiller::getDirection1() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
    18021512  return idx ;
    18031513}
    … …  
    18521562  return MFrequency::showType( frame ) ;
    18531563}
     1564
     1565void MSFiller::reshapeSpectraAndFlagtra( Cube<Float> &sp,
     1566                                         Cube<Bool> &fl,
     1567                                         Table &tab,
     1568                                         Int &npol,
     1569                                         Int &nchan,
     1570                                         Int &nrow,
     1571                                         Vector<Int> &corrtype )
     1572{
     1573  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     1574  //os_ << "start MFiller::reshapeSpectraAndFlagtra() startSec=" << startSec << LogIO::POST ; 
     1575  if ( isFloatData_ ) {
     1576    ROArrayColumn<Bool> mFlagCol( tab, "FLAG" ) ;
     1577    ROArrayColumn<Float> mFloatDataCol( tab, "FLOAT_DATA" ) ;
     1578    sp = mFloatDataCol.getColumn() ;
     1579    fl = mFlagCol.getColumn() ;
     1580  }
     1581  else if ( isData_ ) {
     1582    sp.resize( npol, nchan, nrow ) ;
     1583    fl.resize( npol, nchan, nrow ) ;
     1584    ROArrayColumn<Bool> mFlagCol( tab, "FLAG" ) ;
     1585    ROArrayColumn<Complex> mDataCol( tab, "DATA" ) ;
     1586    for ( Int irow = 0 ; irow < nrow ; irow++ ) {
     1587      Bool crossOK = False ;
     1588      Matrix<Complex> mSp = mDataCol( irow ) ;
     1589      Matrix<Bool> mFl = mFlagCol( irow ) ;
     1590      Matrix<Float> spxy = sp.xyPlane( irow ) ;
     1591      Matrix<Bool> flxy = fl.xyPlane( irow ) ;
     1592      for ( Int ipol = 0 ; ipol < npol ; ipol++ ) {
     1593        if ( corrtype[ipol] == Stokes::XY || corrtype[ipol] == Stokes::YX
     1594             || corrtype[ipol] == Stokes::RL || corrtype[ipol] == Stokes::LR ) {
     1595          if ( !crossOK ) {
     1596            spxy.row( ipol ) = real( mSp.row( ipol ) ) ;
     1597            flxy.row( ipol ) = mFl.row( ipol ) ;
     1598            if ( corrtype[ipol] == Stokes::XY || corrtype[ipol] == Stokes::RL ) {
     1599              spxy.row( ipol+1 ) = imag( mSp.row( ipol ) ) ;
     1600              flxy.row( ipol+1 ) = mFl.row( ipol ) ;
     1601            }                       
     1602            else {
     1603              spxy.row( ipol+1 ) = imag( conj( mSp.row( ipol ) ) ) ;
     1604              flxy.row( ipol+1 ) = mFl.row( ipol ) ;
     1605            }
     1606            crossOK = True ;
     1607          }
     1608        }
     1609        else {
     1610          spxy.row( ipol ) = real( mSp.row( ipol ) ) ;
     1611          flxy.row( ipol ) = mFl.row( ipol ) ;
     1612        }
     1613      }
     1614    }
     1615  }
     1616  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     1617  //os_ << "end MSFiller::reshapeSpectraAndFlagtra() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     1618}
     1619
     1620uInt MSFiller::getDirection( uInt idx,
     1621                             Vector<Double> &dir,
     1622                             Vector<Double> &azel,
     1623                             Vector<Double> &srate,
     1624                             MSPointing &ptab,
     1625                             MEpoch &t,
     1626                             MPosition &antpos )
     1627{
     1628  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     1629  //os_ << "start MFiller::getDirection2() startSec=" << startSec << LogIO::POST ; 
     1630  String refString ;
     1631  MDirection::Types dirType ;
     1632  uInt diridx = getDirection( idx, dir, srate, refString, ptab, t.get("s").getValue() ) ;
     1633  MDirection::getType( dirType, refString ) ;
     1634  MeasFrame mf( t, antpos ) ;
     1635  if ( refString == "J2000" ) {
     1636    MDirection::Convert toazel( dirType, MDirection::Ref( MDirection::AZEL, mf ) ) ;
     1637    azel = toazel( dir ).getAngle("rad").getValue() ;
     1638  }
     1639  else if ( refString(0,4) == "AZEL" ) {
     1640    azel = dir.copy() ;
     1641    MDirection::Convert toj2000( dirType, MDirection::Ref( MDirection::J2000, mf ) ) ;
     1642    dir = toj2000( dir ).getAngle("rad").getValue() ;
     1643  }
     1644  else {
     1645    MDirection::Convert toazel( dirType, MDirection::Ref( MDirection::AZEL, mf ) ) ;
     1646    azel = toazel( dir ).getAngle("rad").getValue() ;
     1647    MDirection::Convert toj2000( dirType, MDirection::Ref( MDirection::J2000, mf ) ) ;
     1648    dir = toj2000( dir ).getAngle("rad").getValue() ;
     1649  }
     1650  if ( srate.size() == 0 )
     1651    srate = Vector<Double>( 2, 0.0 ) ;
     1652  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     1653  //os_ << "end MSFiller::getDirection2() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     1654  return diridx ;
     1655}
     1656
     1657void MSFiller::getSourceDirection( Vector<Double> &dir,
     1658                                   Vector<Double> &azel,
     1659                                   Vector<Double> &srate,
     1660                                   MEpoch &t,
     1661                                   MPosition &antpos,
     1662                                   Vector<MDirection> &srcdir )
     1663{
     1664  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     1665  //os_ << "start MFiller::getSourceDirection() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     1666  Vector<Double> defaultScanrate( 2, 0.0 ) ;
     1667  Vector<Double> defaultDir = srcdir[0].getAngle( "rad" ).getValue() ;
     1668  if ( srcdir.nelements() > 1 )
     1669    defaultScanrate = srcdir[1].getAngle( "rad" ).getValue() ;
     1670  String ref = srcdir[0].getRefString() ;
     1671  MDirection::Types dirType ;
     1672  MDirection::getType( dirType, ref ) ;
     1673  MeasFrame mf( t, antpos ) ;
     1674  if ( ref != "J2000" ) {
     1675    MDirection::Convert toj2000( dirType, MDirection::Ref( MDirection::J2000, mf ) ) ;
     1676    dir = toj2000( defaultDir ).getAngle("rad").getValue() ;
     1677  }
     1678  else
     1679    dir = defaultDir ;
     1680  if ( ref != "AZELGEO" ) {
     1681    MDirection::Convert toazel( dirType, MDirection::Ref( MDirection::AZELGEO, mf ) ) ;
     1682    azel = toazel( defaultDir ).getAngle("rad").getValue() ;
     1683  }
     1684  else
     1685    azel = defaultDir ;
     1686  srate = defaultScanrate ;
     1687  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     1688  //os_ << "end MSFiller::getSourceDirection() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     1689}
     1690
     1691void MSFiller::initHeader( STHeader &header )
     1692{
     1693  header.nchan = 0 ;
     1694  header.npol = 0 ;
     1695  header.nif = 0 ;
     1696  header.nbeam = 0 ;
     1697  header.observer = "" ;
     1698  header.project = "" ;
     1699  header.obstype = "" ;
     1700  header.antennaname = "" ;
     1701  header.antennaposition.resize( 0 ) ;
     1702  header.equinox = 0.0 ;
     1703  header.freqref = "" ;
     1704  header.reffreq = -1.0 ;
     1705  header.bandwidth = 0.0 ;
     1706  header.utc = 0.0 ;
     1707  header.fluxunit = "" ;
     1708  header.epoch = "" ;
     1709  header.poltype = "" ;
     1710}
     1711
     1712String MSFiller::asString( String name,
     1713                           uInt idx,
     1714                           Table tab,
     1715                           boost::object_pool<ROTableColumn> *pool )
     1716{
     1717  ROTableColumn *col = pool->construct( tab, name ) ;
     1718  String v = col->asString( idx ) ;
     1719  pool->destroy( col ) ;
     1720  return v ;
     1721}
     1722
     1723Bool MSFiller::asBool( String name,
     1724                         uInt idx,
     1725                         Table &tab,
     1726                         boost::object_pool<ROTableColumn> *pool )
     1727{
     1728  ROTableColumn *col = pool->construct( tab, name ) ;
     1729  Bool v = col->asBool( idx ) ;
     1730  pool->destroy( col ) ;
     1731  return v ;
     1732}
     1733
     1734uInt MSFiller::asuInt( String name,
     1735                         uInt idx,
     1736                         Table &tab,
     1737                         boost::object_pool<ROTableColumn> *pool )
     1738{
     1739  ROTableColumn *col = pool->construct( tab, name ) ;
     1740  uInt v = col->asuInt( idx ) ;
     1741  pool->destroy( col ) ;
     1742  return v ;
     1743}
     1744
     1745Int MSFiller::asInt( String name,
     1746                        uInt idx,
     1747                        Table &tab,
     1748                        boost::object_pool<ROTableColumn> *pool )
     1749{
     1750  ROTableColumn *col = pool->construct( tab, name ) ;
     1751  Int v = col->asInt( idx ) ;
     1752  pool->destroy( col ) ;
     1753  return v ;
     1754}
     1755
     1756Float MSFiller::asFloat( String name,
     1757                          uInt idx,
     1758                          Table &tab,
     1759                          boost::object_pool<ROTableColumn> *pool )
     1760{
     1761  ROTableColumn *col = pool->construct( tab, name ) ;
     1762  Float v = col->asfloat( idx ) ;
     1763  pool->destroy( col ) ;
     1764  return v ;
     1765}
     1766
     1767Double MSFiller::asDouble( String name,
     1768                           uInt idx,
     1769                           Table &tab,
     1770                           boost::object_pool<ROTableColumn> *pool )
     1771{
     1772  ROTableColumn *col = pool->construct( tab, name ) ;
     1773  Double v = col->asdouble( idx ) ;
     1774  pool->destroy( col ) ;
     1775  return v ;
     1776}
     1777
     1778void MSFiller::sourceInfo( Int sourceId,
     1779                           Int spwId,
     1780                           String &name,
     1781                           MDirection &direction,
     1782                           Vector<casa::Double> &properMotion,
     1783                           Vector<casa::Double> &restFreqs,
     1784                           Vector<casa::String> &transitions,
     1785                           Vector<casa::Double> &sysVels,
     1786                           boost::object_pool<ROTableColumn> *tpoolr )
     1787{
     1788  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     1789  //os_ << "start MFiller::sourceInfo() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     1790
     1791  MSSource srctab = mstable_.source() ;
     1792  MSSource srctabSel = srctab( srctab.col("SOURCE_ID") == sourceId && srctab.col("SPECTRAL_WINDOW_ID") == spwId ) ;
     1793  if ( srctabSel.nrow() == 0 ) {
     1794    srctabSel = srctab( srctab.col("SOURCE_ID") == sourceId && srctab.col("SPECTRAL_WINDOW_ID") == -1 ) ;
     1795  }
     1796  Int numLines = 0 ;
     1797  if ( srctabSel.nrow() > 0 ) {
     1798    // source name
     1799    name = asString( "NAME", 0, srctabSel, tpoolr ) ;
     1800   
     1801    // source proper motion
     1802    ROArrayColumn<Double> roArrDCol( srctabSel, "PROPER_MOTION" ) ;
     1803    properMotion = roArrDCol( 0 ) ;
     1804   
     1805    // source direction as MDirection object
     1806    ROScalarMeasColumn<MDirection> tmpMeasCol( srctabSel, "DIRECTION" ) ;
     1807    direction = tmpMeasCol( 0 ) ;
     1808   
     1809    // number of lines
     1810    numLines = asInt( "NUM_LINES", 0, srctabSel, tpoolr ) ;
     1811  }
     1812  else {
     1813    name = "" ;
     1814    properMotion = Vector<Double>( 2, 0.0 ) ;
     1815    direction = MDirection( Quantum<Double>(0.0,Unit("rad")), Quantum<Double>(0.0,Unit("rad")) ) ;
     1816  }
     1817
     1818  restFreqs.resize( numLines ) ;
     1819  transitions.resize( numLines ) ;
     1820  sysVels.resize( numLines ) ;
     1821  if ( numLines > 0 ) {
     1822    if ( srctabSel.tableDesc().isColumn( "REST_FREQUENCY" ) ) {
     1823      ROArrayQuantColumn<Double> quantArrCol( srctabSel, "REST_FREQUENCY" ) ;
     1824      Array< Quantum<Double> > qRestFreqs = quantArrCol( 0 ) ;
     1825      for ( int i = 0 ; i < numLines ; i++ ) {
     1826        restFreqs[i] = qRestFreqs( IPosition( 1, i ) ).getValue( "Hz" ) ;
     1827      }
     1828    }
     1829    //os_ << "restFreqs = " << restFreqs << LogIO::POST ;
     1830    if ( srctabSel.tableDesc().isColumn( "TRANSITION" ) ) {
     1831      ROArrayColumn<String> transitionCol( srctabSel, "TRANSITION" ) ;
     1832      if ( transitionCol.isDefined( 0 ) )
     1833        transitions = transitionCol( 0 ) ;
     1834      //os_ << "transitionNameCol.nrow() = " << transitionCol.nrow() << LogIO::POST ;
     1835    }
     1836    if ( srctabSel.tableDesc().isColumn( "SYSVEL" ) ) {
     1837      ROArrayColumn<Double> roArrDCol( srctabSel, "SYSVEL" ) ;
     1838      sysVels = roArrDCol( 0 ) ;
     1839    }
     1840  }
     1841 
     1842  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     1843  //os_ << "end MSFiller::sourceInfo() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     1844}
     1845
     1846void MSFiller::spectralSetup( Int spwId,
     1847                              MEpoch &me,
     1848                              MPosition &mp,
     1849                              MDirection &md,
     1850                              Double &refpix,
     1851                              Double &refval,
     1852                              Double &increment,
     1853                              Int &nchan,
     1854                              String &freqref,
     1855                              Double &reffreq,
     1856                              Double &bandwidth,
     1857                              boost::object_pool<ROTableColumn> *tpoolr )
     1858{
     1859  //double startSec = gettimeofday_sec() ;
     1860  //os_ << "start MFiller::spectralSetup() startSec=" << startSec << LogIO::POST ;
     1861
     1862  MSSpectralWindow spwtab = mstable_.spectralWindow() ;
     1863  MeasFrame mf( me, mp, md ) ;
     1864  MFrequency::Types freqRef = MFrequency::castType( (uInt)asInt( "MEAS_FREQ_REF", spwId, spwtab, tpoolr ) ) ;
     1865  Bool even = False ;
     1866  if ( (nchan/2)*2 == nchan ) even = True ;
     1867  ROScalarQuantColumn<Double> tmpQuantCol( spwtab, "TOTAL_BANDWIDTH" ) ;
     1868  Double totbw = tmpQuantCol( spwId ).getValue( "Hz" ) ;
     1869  if ( nchan != 4 )
     1870    bandwidth = max( bandwidth, totbw ) ;
     1871  if ( freqref == "" && nchan != 4)
     1872    //sdh.freqref = MFrequency::showType( freqRef ) ;
     1873    freqref = "LSRK" ;
     1874  if ( reffreq == -1.0 && nchan != 4 ) {
     1875    tmpQuantCol.attach( spwtab, "REF_FREQUENCY" ) ;
     1876    Quantum<Double> qreffreq = tmpQuantCol( spwId ) ;
     1877    if ( freqRef == MFrequency::LSRK ) {
     1878      reffreq = qreffreq.getValue("Hz") ;
     1879    }
     1880    else {
     1881      MFrequency::Convert tolsr( freqRef, MFrequency::Ref( MFrequency::LSRK, mf ) ) ;
     1882      reffreq = tolsr( qreffreq ).get("Hz").getValue() ;
     1883    }
     1884  }
     1885  Int refchan = nchan / 2 ;
     1886  IPosition refip( 1, refchan ) ;
     1887  refpix = 0.5*(nchan-1) ;
     1888  refval = 0.0 ;
     1889  ROArrayQuantColumn<Double> sharedQDArrCol( spwtab, "CHAN_WIDTH" ) ;
     1890  increment = sharedQDArrCol( spwId )( refip ).getValue( "Hz" ) ;
     1891  //           os_ << "nchan = " << nchan << " refchan = " << refchan << "(even=" << even << ") refpix = " << refpix << LogIO::POST ;
     1892  sharedQDArrCol.attach( spwtab, "CHAN_FREQ" ) ;
     1893  Vector< Quantum<Double> > chanFreqs = sharedQDArrCol( spwId ) ;
     1894  if ( nchan > 1 && chanFreqs[0].getValue("Hz") > chanFreqs[1].getValue("Hz") )
     1895    increment *= -1.0 ;
     1896  if ( freqRef == MFrequency::LSRK ) {
     1897    if ( even ) {
     1898      IPosition refip0( 1, refchan-1 ) ;
     1899      Double refval0 = chanFreqs(refip0).getValue("Hz") ;
     1900      Double refval1 = chanFreqs(refip).getValue("Hz") ;
     1901      refval = 0.5 * ( refval0 + refval1 ) ;
     1902    }
     1903    else {
     1904      refval = chanFreqs(refip).getValue("Hz") ;
     1905    }
     1906  }
     1907  else {
     1908    MFrequency::Convert tolsr( freqRef, MFrequency::Ref( MFrequency::LSRK, mf ) ) ;
     1909    if ( even ) {
     1910      IPosition refip0( 1, refchan-1 ) ;
     1911      Double refval0 = chanFreqs(refip0).getValue("Hz") ;
     1912      Double refval1 = chanFreqs(refip).getValue("Hz") ;
     1913      refval = 0.5 * ( refval0 + refval1 ) ;
     1914      refval = tolsr( refval ).get("Hz").getValue() ;
     1915    }
     1916    else {
     1917      refval = tolsr( chanFreqs(refip) ).get("Hz").getValue() ;
     1918    }
     1919  }
     1920 
     1921  //double endSec = gettimeofday_sec() ;
     1922  //os_ << "end MSFiller::spectralSetup() endSec=" << endSec << " (" << endSec-startSec << "sec)" << LogIO::POST ;
     1923}
     1924
    18541925} ;
    18551926

  • trunk/src/MSFiller.h

    r2234 r2237  
    9191  // get direction for DIRECTION, AZIMUTH, and ELEVATION columns
    9292  casa::uInt getDirection( casa::uInt idx, casa::Vector<casa::Double> &dir, casa::Vector<casa::Double> &srate, casa::String &ref, casa::MSPointing &tab, casa::Double t ) ;
     93  casa::uInt getDirection( casa::uInt idx, casa::Vector<casa::Double> &dir, casa::Vector<casa::Double> &azel, casa::Vector<casa::Double> &srate, casa::MSPointing &tab, casa::MEpoch &t, casa::MPosition &antpos ) ;
     94  void getSourceDirection( casa::Vector<casa::Double> &dir, casa::Vector<casa::Double> &azel, casa::Vector<casa::Double> &srate, casa::MEpoch &t, casa::MPosition &antpos, casa::Vector<casa::MDirection> &srcdir ) ;
    9395
    9496  // create key for TCAL table
    … …  
    103105  // get frequency frame
    104106  std::string getFrame() ;
    105  
     107
     108  // reshape SPECTRA and FLAGTRA
     109  void reshapeSpectraAndFlagtra( casa::Cube<casa::Float> &sp,
     110                                 casa::Cube<casa::Bool> &fl,
     111                                 casa::Table &tab,
     112                                 casa::Int &npol,
     113                                 casa::Int &nchan,
     114                                 casa::Int &nrow,
     115                                 casa::Vector<casa::Int> &corrtype ) ;
     116 
     117  // initialize header
     118  void initHeader( STHeader &header ) ;
     119
     120  // get value from table column using object pool
     121  casa::String asString( casa::String name,
     122                         casa::uInt idx,
     123                         casa::Table tab,
     124                         boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
     125  casa::Bool asBool( casa::String name,
     126                     casa::uInt idx,
     127                     casa::Table &tab,
     128                     boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
     129  casa::Int asInt( casa::String name,
     130                   casa::uInt idx,
     131                   casa::Table &tab,
     132                   boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
     133  casa::uInt asuInt( casa::String name,
     134                     casa::uInt idx,
     135                     casa::Table &tab,
     136                     boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
     137  casa::Float asFloat( casa::String name,
     138                       casa::uInt idx,
     139                       casa::Table &tab,
     140                       boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
     141  casa::Double asDouble( casa::String name,
     142                         casa::uInt idx,
     143                         casa::Table &tab,
     144                         boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
     145
     146  void sourceInfo( casa::Int sourceId,
     147                   casa::Int spwId,
     148                   casa::String &name,
     149                   casa::MDirection &direction,
     150                   casa::Vector<casa::Double> &properMotion,
     151                   casa::Vector<casa::Double> &restFreqs,
     152                   casa::Vector<casa::String> &transitions,
     153                   casa::Vector<casa::Double> &sysVels,
     154                   boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
     155
     156  void spectralSetup( casa::Int spwId,
     157                      casa::MEpoch &me,
     158                      casa::MPosition &mp,
     159                      casa::MDirection &md,
     160                      casa::Double &refpix,
     161                      casa::Double &refval,
     162                      casa::Double &increment,
     163                      casa::Int &nchan,
     164                      casa::String &freqref,
     165                      casa::Double &reffreq,
     166                      casa::Double &bandwidth,
     167                      boost::object_pool<casa::ROTableColumn> *pool ) ;
     168
    106169  casa::CountedPtr<Scantable> table_ ;
    107170  casa::MeasurementSet mstable_ ;
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.